Bsu DNA 聚合酶,大片段
#M0330L 1,000 units
#M0330S 200 units
特性
概述
来源
浓度
5,000 units/ml。
热失活
75℃ 20 分钟。
注意事项
25℃ 时 Bsu DNA 聚合酶,大片段 保留 50% 的活性,是同温度下 Klenow 片段(3´→5´ exo–)的两倍。
5,000 units/ml。
75℃ 20 分钟。
克隆有 topA 基因的重组 E. coli 菌株。
5,000 units/ml 和 15,000 units/ml。
A 52.8 kDa non-glycosylated protein with a very high affinity for biotin. Due to its high affinity for biotin, it is used to bridge biotinylated probes and biotinylated enzymes.
1 mg/ml
Excitation
0nm
-20°C
140 mM NaCl
8 mM sodium phosphate
2 mM potassium phosphate
10 mM KCl
pH 7.4 @ 25°C
10,000 units/ml。
克隆有 Endo IV 基因的重组 E. coli 菌株。
10,000 units/ml。
– 随机引物混合液(60 μM)、Oligo d(T)23VN 引物(50 μM)**、无核酸酶污染的水
**Oligo d(T)23 VN 和随机引物混合液包含 1 mM dNTP
如需稳定扩增不同种类的 DNA 模板,推荐使用 OneTaq® DNA 聚合酶或 Q5® 超保真 DNA 聚合酶。
1 单位指在 10 μl反应体系中,37℃ 条件下,1 小时内能够切割 1 pmol 含单脱氧次黄嘌呤核苷位点* 的 34 mer 寡核苷酸双链所需要的酶量。
10,000 units/ml。
莫洛尼氏鼠白血病病毒(M-MuLV)反转录酶是一种 RNA 介导的 DNA 聚合酶。该酶能以 RNA(合成 cDNA 时)或单链 DNA 做模板由引物起始合成一条互补的 DNA。M-MuLV 反转录酶无 3´→5´ 核酸外切酶活性。
重组 E. coli 菌株,携带有从 M-MuLV 中克隆的反转录酶基因。
1X M-MuLV 反转录酶反应缓冲液 [50mM Tris-HCl(pH 8.3 @ 25℃),75 mM KCl,3 mMMgCl2,10 mM DTT],加入 dNTPs(不随酶提供),37-42℃ 温育。热失活:65℃ 20 分钟。
无核酸内切酶、外切酶和 RNase 污染。
1 单位指以 poly(rA)为模板、oligo(dT)为引物,在 37℃ 条件下,10 分钟内催化 1 nmol 的 dTTP 掺入形成酸不溶物所需要的酶量。
200,000 units/ml。
含有编码 T4 denV 基因质粒的 E. coli 菌株。
10,000 units/ml。
beta-Nicotinamide adenine dinucleotide (NAD+)
操作简便
不损伤模板
PreCR 修复混合液是一种鸡尾酒式的酶混合试剂,用于在 PCR 反应、微阵列分析或其它 DNA 技术之前,修复受损的 DNA 模板。PreCR 修复混合液作用于多种受损 DNA,包括那些阻碍 PCR 反应的损伤(如:缺嘌呤/缺嘧啶点、胸腺嘧啶二聚体、切刻和缺口)和经诱导而发生突变的位点(如:脱氨基胞嘧啶和 8-氧鸟嘌呤)。此外,它将去除 DNA 3´ 末端的多种半基团而保留羟基基团。PreCR 修复混合液不能修复所有抑制和干扰 PCR 的损伤。PreCR 修复混合液可以与任何一种嗜热聚合酶配合使用。
混合液中每一种重组蛋白都来自 E.coli 菌株的表达。
在 PCR 或其它 DNA 技术之前修复 DNA。
纯化的 BSA
使用 PreCR 修复混合液修复不同类型的 DNA 损伤。胶图显示了经过 PreCR 修复混合液处理(+)和未经处理(-)的受损 DNA 的扩增结果。DNA 损伤的类型已经在图上方给出。注意:热处理 DNA 为 99℃ 温育 3 分钟。Marker M 是 2- Log DNA Ladder (NEB #3200)。
DNA 损伤类型
10,000 units/ml。
WarmStart® RTx 反转录酶是一种依赖 RNA 的 DNA 聚合酶,它利用核酸适配体技术,通过共价键作用结合到聚合酶上,从而抑制 RTx 在 40℃ 以下的活性。WarmStart RTx 以 RNA(cDNA 合成)或单链 DNA 作为模板合成互补 DNA 链。RTx 酶适用于扩增反应中 RNA 的检测,特别适用于 LAMP(环介导等温扩增)实验。WarmStart 特性是:特别适用于高通量反应,室温下建立反应,并提高扩增反应的一致性和特异性。RTx 反转录酶包含完整的 RNase H 活性。
重组 E. coli 菌株,携带有基因工程改造的RTx 基因。
无核酸内切酶、外切酶和 RNase 污染。
15,000 units/ml。
• 反转录延伸能力强,可快速获得大量长片段 cDNA
体验新型反转录酶,感受II 型内含子编码的反转录酶带来的超强反转录活性
Induro 反转录酶是由 II 型内含子编码的反转录酶,在 RNA 反转录合成 cDNA 过程中,展示出更强持续合成能力、热稳定性,以及抑制剂耐受能力。特别适用于长转录本、复杂二级结构,以及含有抑制成分的 RNA 样品反转录合成 cDNA。Induro 反转录酶提升了长转录本的 5′ 端测序覆盖度,因此适用于 RNA-seq 应用,例如:RNA 直接测序、长片段 cDNA 测序。
图 1:Induro 反转录酶的持续合成能力强,能够快速高效合成 cDNA
Induro 反转录酶能够在 55℃ 条件下,5 分钟内合成 12 kb cDNA 全长产物。以体外转录获得的不同长度且带有 Poly (A) 尾的 RNA 作为模板 (1 kb、4 kb、8 kb 或 12 kb),验证全长 cDNA 反转录效果。验证全长 cDNA 的合成效果。首先,合成第一链 cDNA,随后,用 NaOH 水解 RNA 链,然后,将 cDNA 产物等分,分别加入 5´ 特异性引物合成全长双链 cDNA。最后,在琼脂糖凝胶上加入等体积的双链 cDNA 产物进行检测。
图 2:Induro 反转录酶热稳定性能卓越,能够在更高反应温度下稳定合成
Induro 反转录酶能够在 45°C-60°C条件下,10 分钟内合成 12 kb cDNA 全长产物。以体外转录获得的不同长度且带有 Poly (A) 尾的 RNA 作为模板 (1 kb、4 kb、8 kb 或 12 kb),验证全长 cDNA 的合成效果。首先,合成第一链 cDNA,随后,用 NaOH 水解 RNA 链,然后,将 cDNA 产物等分,分别加入 5´ 特异性引物合成全长双链 cDNA。最后,在琼脂糖凝胶上加入等体积的双链 cDNA 产物进行检测。
图 3:Induro 反转录酶合成长片段 cDNA 时,产量最高
转录本长度 ≥8 kb 时,Induro 反转录酶合成的 cDNA 产量最高。以体外转录获得的不同长度且带有 Poly (A) 尾的 RNA 作为模板 (1 kb、4 kb、8 kb 或 12 kb) 。首先,合成第一链 cDNA,随后,水解 RNA 链,加入 5´ 特异性引物合成第二链 cDNA
图 4:Induro 反转录酶能够以复杂的人 RNA 为模板,反转录合成长片段 cDNA
Induro 反转录酶能够以人总 RNA 为模板,分别在 50°C、55°C 或 60°C 条件下,经 10 分钟孵育,合成 >14 kb cDNA 产物。第一链 cDNA 合成后,将产物等分,使用 LongAmp® Taq 2X 预混液 (NEB #M0287) 进行 PCR。
图 5:Induro 反转录酶耐受抑制剂的能力比 TGIRT 更强
与 TGIRT®-III酶 (T) 相比,Induro 反转录酶 (I) 对 RNA 生物样品中常见的抑制成分耐受力更强。在 20 μ 反转录体系中加入 1 μg 长度为 8 kb 的 RNA 体外转录产物(含 poly A)和 oligo dT23VN。所有反应组分(包含 RT 酶)在冰上混合均匀后,加入抑制剂。Induro 的反转录条件为:55°C 10 min,95°C 1 min。TGIRT 的反转录条件为:60℃ 60 min,95℃ 1 min。图中抑制剂含量为其在第一链 cDNA 合成体系中的终浓度。之后加入 5´ 特异性引物合成第二链。
1,000 units/ml。
切割错配核酸内切酶 I 是一种依赖 Mg2+ 的 DNA 核酸内切酶,可特异切割错配碱基对(T:T、G:G 和 T:G 错配)。切割错配核酸内切酶 I 在两条链上错配碱基 5’端的第三个磷酸二酯键处切割,切割后产生 5 bp 粘性末端。切割错配核酸内切酶 I 优先切割的 DNA 错配为:T:T、G:G 和 T:G,也可轻松切割 T:I、G:I 和 G:U 错配。此外,实验证明:切割错配核酸内切酶 I 在 T:C 类型的 DNA 错配中可在含 T 的链上形成切刻。该酶还能切割 DNA:RNA 杂交链上的 T:G 和 T:U 错配,但其切割效率低于 DNA:DNA 错配。
(A)构建四个在同一位点包含特定突变质粒(p1-p4),使用差异磷酸化引物(正向或反向)扩增生成 8 个双链 PCR 片段,长度约 672 bp (ds1-ds8)。经 Monarch PCR & DNA 纯化试剂盒(NEB #T1030)纯化后,使用 5 units Lambda 核酸外切酶,经37℃孵育 60 分钟,以特异性降解双链片段中的磷酸化链(2.2 µg),从而产生一系列单链(正链/负链),同一位点碱基为 A/T/C/G。随后使用 Monarch PCR & DNA 纯化试剂盒(NEB #T1030)对这些单链片段(ss1-ss8)进行纯化。
(B)将纯化后的含有 A/T/C/G 的单链片段进行混合,可形成精准配对的 DNA(绿色 √ 框)或含单碱基错配的双链片段(黄色 × 框)。为了生含错配碱基的双链,在下述条件下,选择特定的正/反义链进行混合:在 1X NEBuffer 2.1 中重新退火,加热至 95℃,再冷却至室温。上述实验可产生 8 种 DNA 错配(A:A、A:C、A:G、C:C、C:T、G:G、G:T、T:T)。(C)如下方法检测该酶切割 dsDNA 中特定错配的能力:在 200 ng 含错配的 dsDNA 中加入 80 units 切割错配核酸内切酶 I,37℃孵育 30 分钟。后将产物进行琼脂糖(1.2%)凝胶电泳并用溴化乙锭染色观察。
图 2.切割错配核酸内切酶 I 能够切割双链 DNA 上的 T:T、G:T 和 G:G 错配
1,000 units/ml 和15,000 units/ml
Luna 通用 qPCR 预混液
·15 分钟内完成 cDNA 第一链的合成
·与 Luna qPCR 预混液搭配使用,RT-qPCR 效果更优异
LunaScript SuperMix 反转录试剂盒是经过优化的预混液,用于两步法 RT–qPCR 的第一步 cDNA 第一链合成。该预混液最具特色的是采用了耐热 Luna 反转录酶,可在高温下合成 cDNA。预混液中的小鼠 RNase 抑制剂可保护模板 RNA 不被降解。在预混液中同时含有 6 碱基随机引物和 poly-dT 引物,可覆盖全长目标 RNA。
– LunaScript RT SurperMix
1X HpaII 甲基转移酶缓冲液 + SAM
[50 mM Tris-HCl(pH 7.5 @ 25℃),10 mM EDTA,5 mM 2-巯基乙醇]。加入 80 μM SAM(随酶提供),37℃ 温育。
热失活:65℃ 加热 20 分钟。
4,000 units/ml。
使用 LunaScript 反转录预混液试剂盒(无引物)将 1 μg Jurkat 总 RNA 反转录成 cDNA,引物为 d(T))23VN,使用标准反应条件 55℃ 孵育 10 分钟,95℃ 孵育 1 分钟。之后使用不同 PCR 扩增试剂对 cDNA 产物进行检测。对于 5 kb以内的常规应用,建议使用 OneTaq 2X 预混液(NEB #M0482);对于高保真扩增,建议使用 Q5 热启动超保真 2X 预混液(NEB #M0494);对于长片段高产量扩增,建议使用 LongAmp Taq 2X 预混液(NEB #M0287)(数据未显示)
细胞培养常用于替代活体生物来分析基因表达或对治疗的反应。传统上使用柱提法或化学试剂法从处理过的细胞中提取和纯化 RNA.Luna Cell Ready 裂解模块无需进行传统的 RNA 提取步骤即可评估RNA表达水平,是一种快速、方便且灵敏的替代方案。该模块可同时进行细胞裂解、RNA 释放、基因组 DNA 去除,获得的细胞裂解物可直接使用Luna通用一步法 RT-qPCR 试剂盒进行 RT-qPCR 分析。与其它 Luna 产品一样,裂解缓冲液包含惰性蓝色示踪染料,使整个加样流程可视化。
下表列出的细胞系可使用 Luna Cell Ready 裂解模块裂解。这些细胞进行 5 log 梯度稀释(100000-10 细胞/50 µl 裂解反应),并取 1 ul 裂解产物进行 20 µl 体系的一步法 RT-qPCR 反应。每个细胞系的线性结果区域显示在最后一列。此外,经测试一些昆虫细胞系也能用上述裂解液裂解。
表一:经验证过的细胞系
细胞系 |
特性 |
菌种 |
50 ml 裂解体系中的细胞数量 |
A549 |
Adherent |
H. sapiens, Lung, carcinoma |
10 – 100,000 |
HEK293 |
Adherent |
H. sapiens, Kidney |
10 – 100,000 |
HeLa |
Adherent |
H. sapiens, Cervix, adenocarcinoma |
10 – 100,000 |
HepG2 |
Adherent |
H. sapiens, Liver, carcinoma |
10 – 100,000 |
NCI-H460 |
Adherent |
H. sapiens, Lung, carcinoma |
10 – 100,000 |
SK-N-SH |
Adherent |
H. sapiens, Brain, Neuroblastoma |
10 – 100,000 |
U2Os |
Adherent |
H. sapiens, Bone, osteosarcoma |
10 – 10,000 |
Jurkat |
Suspension |
H. sapiens, T lymphocyte, leukemia |
10 – 100,000 |
K-562 |
Suspension |
H. sapiens, Lymphoblast, leukemia |
10 – 1,000 |
图一:Luna Cell Ready 一步法 RT-qPCR 实验流程
Luna Cell Ready 裂解模块整合了 DNase I 和 Luna Cell Ready 蛋白酶的功能,可简单高效的进行细胞裂解,仅需 15 分钟即可完成细胞裂解、RNA 释放和基因组 DNA 去除。2 µl 裂解产物(相当于 0.2–4000 个细胞中的 RNA)即可实现 20 µl 体系的 RT-qPCR 反应。
试剂盒组分
随该产品提供的试剂
储存(°C) |
浓度 |
|
Luna Cell Ready Lysis Buffer |
-20 |
2 X |
Luna Cell Ready RNA Protection Reagent |
-20 |
25 X |
Luna Cell Ready Protease |
-20 |
25 X |
Luna Cell Ready Stop Solution |
-20 |
10 X |
DNase I (RNase-free) |
-20 |
10 X |
实验需要但不提供的试剂耗材
储存温度
-20℃
4,000 units/ml。
快速、灵敏、精确的实时荧光染料定量检测 DNA 和 cDNA
使用实时荧光染料定量 PCR 时,最常用的荧光染料是 SYBR® Green I,后者与双链 DNA 结合,检测每个 PCR 循环中的 DNA 扩增情况。Cq 值是循环数量值,即检测到的荧光信号超过背景本底信号域值所经历的循环数,该 Cq 值可用于评估两个或两个以上的样本之间的相对丰度,也可以与已知浓度系列稀释的标准曲线进行对比,读取样本绝对值。
NEB Luna Universal qPCR Master Mix 是经过优化的 2X 预混液,可以用于实时定量 PCR检测和目标 DNA 的定量,适用于具有 SYBR®/FAM 通道的大部分 qPCR 设备。预混液含有热启动 Taq DNA 聚合酶及独特校正染料,与一系列 qPCR 设备兼容;预混液中使用了 dUTP,以防止产物残留污染;预混液中还加有非荧光染料,便于建立反应时进行肉眼观察,该染料的光谱与 qPCR 荧光染料不重叠,因此不会影响到实时检测数值。
预混液为 2X,包含除了模板和引物以外,用于 PCR 扩增和定量检测的所有组分。可以使用商业化的 qPCR 分析引物,用 Luna qPCR 产品进行基因组 DNA 或者 cDNA 的定量分析。
图表一:NEB 的 Luna Universal qPCR Master Mix 为 qPCR 带来更高灵敏度及可重复性
使用 Luna Universal qPCR Master Mix 检测目标中 GAPDH 基因的表达情况,模板为 6个分别 10 倍稀释的 Jurkat cDNA (20 ng – 0.2 pg),每个浓度的样品做8个复孔。cDNA 是使用 NEB Protoscript® II First Strand cDNA Synthesis Kit (NEB #E6560) 从 Jurkat 的总 RNA 反转录得来。
图表二:NEB 的 Luna Universal qPCR Master Mix 为不同来源的 DNA 都能提供更高灵敏度和精确度的检测和定量
Luna Universal qPCR Master Mix 可以检测不同来源的基因组 DNA。使用 ABI 7500 快速荧光定量仪器,50 ng – 0.5 pg 的基因组 DNA 对目标进行实时定量检测。基因组 DNA使用传统的柱纯化方法纯化。无论从小鼠肾脏的基因组检测 ACTB 基因、烟草基因组 DNA 检测 psbB 基因、还是从酵母基因组 DNA 中检测 rdn18S,Luna 产品都有非常优秀的表现。
图表三:通过与市场上基于染料的 qPCR 试剂对比,NEB 的 Luna 产品体现出了更优的稳定性和特异性
使用 NEB 公司和其它供应商的试剂,分别对来自于 Jurkat 基因组 DNA或 Jurkat cDNA不同丰度、长度和 GC 含量的 16-18 个目的基因进行检测(使用 Bio-Rad 机器检测 10 个基因组模板和 8 cDNA 模板,使用 ABI 的机器检测9个基因组模板和7 个 cDNA 模板)。每份检测结果由两个实验者根据厂商要求分别得到。使用反应效率、最低检测值以及无模板扩增来衡量结果(ΔCq = average Cq of lowest input – average Cq of non-template control)。此外,一致性、可重复性以及曲线的整体质量评估也作为实验的参考(标准分数)。上面的点状图展示了符合可接受的性能标准的百分比(绿框圈起来的点的标准分>3)。不同厂商的结果如上图所示,从左到右分别是:NEB;Bio-Rad, SsoAdvanced™ Universal SYBR® Green Supermix; Roche, FastStart™ SYBR Green Master; QIAGEN, QuantiTect® SYBR Green PCR Kit; ABI, PowerUP™ SYBR Green Master Mix; Promega®, GoTaq® qPCR Master Mix。NEB 的Luna Universal qPCR Master Mix 表现优于所有其它供应商试剂的结果。
1. 引物设计
使用相关软件(如 Primer 3)设计 qPCR 引物时,在减少非特异性扩增和引物二聚体的情况下提高扩增成功率。引物的 GC 含量为 40–60% 可以保证最大的扩增效率。在可能的情况下,尽可能多的输入目标周围区域序列,以便引物序列设计更加完善。使用检索功能,检索相关数据库以避免非特异性扩增。如果模板是 cDNA ,在设计引物的时候可以跨内含子区域来避免基因组的非特异性扩增。相反,如果引物设计在内含子区域则可以保证基因组区域的特异性扩增。
2. 引物浓度
对于大多数模板来说,引物的终浓度 250 nM 就可以达到要求。如果需要的话,引物的浓度可以在 100–500 nM 之间优化。
3. 扩增子长度
为了确保 qPCR 结果的成功和一致性,PCR 效率的最大化非常重要。其中一方面就是设计短的 PCR 产物(70-200 bp)。如果反应产物超出范围,可能需要对实验进行优化(比如增加延伸时间等)
4. 模板准备及相关浓度
Luna qPCR 试剂与通过典型的核酸纯化方法纯化的 DNA 样本都兼容。制备好的 DNA 可以长期稳定储存在包含 EDTA 的缓冲液中(如 1X TE),实验时使用 TE buffer 或者水进行稀释。
一般来说,标准品和未知样品的浓度范围应该在 1 个拷贝到 106 个拷贝之间。如果是大型基因组样本(如人类或老鼠的 gDNA)一般浓度为 50 ng-1 pg。如果是小型基因组样本,可以参考使用1 个拷贝到 106 个拷贝的浓度。对于单一样本的稀释,样本中需要包含多个拷贝和空白对照。对于 cDNA 样本,可以使用 1 μg–0.1 pg 的 RNA 的反转录产物。cDNA 样本不需要纯化,但是在使用之前需要至少稀释 10 倍
5. ROX 校正染料
有些实时定量设备建议使用校正染料(通常是 ROX)来校正由于气泡、微小的体积差别、管与管之间的差异及反应过程中尘埃或者微粒的自发荧光造成的反应差距。Luna Universal qPCR Master Mix 包含了通用型的校正染料,可以兼容不需要使用校正染料以及需要使用低浓度或者高浓度校正染料(ROX)的一系列的荧光定量检测仪器。因此,在使用这些仪器进行 qPCR 实验时,不需要额外的组分。
6. 预防污染
qPCR 是一种非常灵敏的检测方法,前个 qPCR 产物污染下一个样本会带来一系列的问题,如假阳性及灵敏度的下降。防止污染的最好办法就是严格按照程序操作,避免扩增后的开盖。为了进一步满足预防交叉污染的要求,Luna Universal qPCR Master Mix 中包含了 dUTP/dTTP,从而可以在扩增过程中将 U 掺入到 DNA 产物中。qPCR 前使用尿嘧啶 DNA 糖基化酶(UDG)进行预先处理,就可以水解含有尿嘧啶的产物,以防止污染后续试验。使用能够完全失活的 UDG 是至关重要的,否则 UDG 会破坏新合成的 qPCR 产物。
为了避免产物携带污染,在反应体系中加入终浓度为 0.025 units/μl 的南极热敏 UDG(NEB #M0372)。欲将污染的可能性降到最低,最好在室温下建立反应或者在变性步骤前加上
25℃ 温育 10 分钟
7. 反应条件设定
由于聚合酶的热启动性,在实验前不需要预热机器,也不需要在冰上加样。
如果使用96 孔板,建议使用 20 μl 反应体积。
如果使用 384 孔板,建议使用 10 μl 反应体积。在设定仪器的循环条件时,保证在延伸结束时包含一次读板并在循环结束后生成溶解曲线以分析产物的特异性。
大部分应用分析反应 40 个循环就可以,低起始量的样本可以反应 45 个循环。
LunaScript 反转录 SuperMix 为优化的反转录预混液,可用于第一链 cDNA 合成、扩增子测序,以及两步法 RT-qPCR。该预混液含有具备热稳定特性的 Luna 反转录酶,可在更高温下合成 cDNA。试剂盒还提供小鼠 RNase 抑制剂,以保护模板 RNA 免受降解。LunaScript 反转录 SuperMix 预混液含有随机六聚体引物,Oligo-dT 引物,可均匀覆盖整个 RNA 靶标。此外,预混液还包含蓝色染料,可在两步法 RT-qPCR 起到示踪作用。样品起始量从高达 1 µg 到低至单拷贝 RNA,均能得到稳健、线性和灵敏的检测结果。
LunaScript 反转录预混液试剂盒(无引物) (NEB #E3025) 包含除引物外,第一链 cDNA 合成所需的所有组分,适用于 RT-PCR、RNA-seq 及其它应用。该预混液与随机引物、oligo dT 引物以及基因特异性引物兼容,让 cDNA 合成更灵活。更多信息请点击 https://www.neb.cn/products/e3025-lunascript-rt-master-mix-kit-primer-free
与 LunaScript 试剂盒版本 (NEB #E3010) 相比,该 LunaScript 预混液版本不含无核酶水和 No-RT 对照。更多信息如下:
图 1:LunaScript 产品比较
图 2:一步法和两步法 RT-qPCR 产品选择
图 3:LunaScript® SuperMix 反转录预混液在两步法 RT-qPCR 实验中展现了出色的灵敏度、线性关系和重复性
在 20 μl 反应体系中,使用 1 X LunaScript 反转录 SuperMix预混液,在标准反应条件下(25℃/2 分钟,55℃/10 分钟,95℃/1 分钟)将 RNA 反转录为 cDNA。然后使用 1 μl cDNA 作为模板和 Luna 通用 qPCR 预混液(NEB#M3003)进行 qPCR 定量,每种浓度做三个重复。
A. 将梯度稀释的 Jurkat 总 RNA(1 μg–1 pg)反转录为 cDNA,然后对 β-actin 进行 qPCR 定量。
B. ERCC 对照(External RNA Controls Consortium)mix1 RNA 包含 50 – 5×109 拷贝的ERCC00130(10 fg–~10 ng),反转录为 cDNA 后进行 qPCR 进行定量。
图 4:LunaScript 反转录 SuperMix 预混液可覆盖长转录本
在标准反应条件(25℃/2 min、55℃/10 min、95℃/1 min)下,20 μl反应体系中,使用 1X LunaScript 反转录 SuperMix 预混液,将 Jurkat 总 RNA (1 μg – 1 ng) 反转录为 cDNA。取 1 μl cDNA 产物做为模板,使用 Luna 通用 qPCR 预混液 (NEB #M3003) 和覆盖 HERC1 整个 15.2 kb 转录本的 8 对引物,对 cDNA 覆盖度进行 qPCR 评估。结果显示:所有扩增靶标在每个上样浓度的重复实验中,均有良好扩增。
图 5:LunaScript 反转录 SuperMix 预混液对 RNA 靶标展现了出色的线性检测能力
使用市售的 cDNA 合成预混液,根据各厂商产品说明书,将 100 pg–1 μg 人(Jurkat)总 RNA 反转录为 cDNA。然后通过 8 个靶标(丰度、长度和 GC 含量不同)的 qPCR 结果对 cDNA 产物进行评估。使用 Luna 通用 qPCR 预混液(NEB#M3003)或 Luna 通用探针法 qPCR 预混液(NEB#M3004)进行 qPCR 检测。结果评估了扩增效率和 ΔCq,其中 ΔCq 衡量低起始量检测和缺乏无模板对照(NTC)扩增(ΔCq = NTC 的平均 Cq–最低起始量的平均 Cq)。绿色框表示目标扩增表现(效率 = 90-110%,ΔCq≥3)。
了解更多“Dots in Boxes”可视化荧光定量评价方法,请登陆:https://www.neb.cn/tools-and-resources/video-library/dots-in-boxes-visualization-of-qpcr-data
图 6:LunaScript 反转录 SuperMix 预混液的第一链 cDNA 合成时间最短,仅需 13 分钟。
比较了不同厂家的 cDNA 合成方案。LunaScript 反转录 SuperMix 预混液需要的反应时间最短,并可以耐受高温,避免了 RNA 复杂二级结构的影响。
图 7:LunaScript 反转录 SuperMix 预混液在室温条件下稳定性极佳
LunaScript 反转录 SuperMix 预混液与其它市售反转录产品在 25℃条件下放置 15 天,之后在说明书推荐反应条件下,以 100 pg–1 μg 人总 RNA (Jurkat) 为模板,反转录成为 cDNA。使用 Luna 通用 qPCR 预混液(NEB#M3003)对 8 个不同丰度、长度和 GC 含量的靶标进行 qPCR 检测。结果评估了扩增效率和 ΔCq,其中 ΔCq 衡量低起始量检测和缺乏无模板对照(NTC)扩增(ΔCq = NTC 的平均 Cq – 最低起始量的平均 Cq)。绿色框表示目标扩增表现(效率 = 90-110%,ΔCq≥3)。
Monarch DNA 纯化离心柱(5 μg)
Monarch PCR & DNA 纯化试剂盒(5 μg)是一款快速可靠的的纯化试剂盒,可从酶学反应中纯化和浓缩高达 5 μg 例如 PCR、酶切、连接和反转录产物。该方法减少结合、漂洗和洗脱过程中的温育和离心时间,5 分钟之内即可完成纯化实验。DNA 纯化结合缓冲液用于稀释样本以确保 DNA 在高盐环境下结合到专有的二氧化硅基质上。DNA 纯化漂洗缓冲液将酶、短链引物(≤40 nt)、变性剂和其它小分子量的反应成分(如核苷酸,DMSO,甜菜碱)去除,从而实现更低体积的洗脱,得到高浓度高纯度的 DNA。洗脱得到的 DNA 可以用于限制性酶切、DNA 测序、连接反应和其它酶学等下游实验。独特的纯化离心柱设计消除了液体残留及污染并且洗脱体积最低可至 6 μl。
• PCR 纯化
– Monarch DNA 纯化离心柱(5 μg)
Taq 、Vent、Deep Vent、Bst 全长、Bst 大片段、Sulfolobus IV 和 Therminator DNA 聚合酶都随酶提供
10X ThermoPol 反应缓冲液,该缓冲液稀释成终浓度为 1X 时含有 2 mM MgSO4。另外还有不含Mg2+的
10X ThermoPol 反应缓冲液,用于要求 Mg2+ 浓度低于 2 mM 的反应。
Taq DNA 聚合酶随酶提供标准 Taq 反应缓冲液,可以替换 ThermoPol 反应缓冲液。
Bst 2.0 和 Bst 2.0 WarmStart DNA 聚合酶都随酶提供等温扩增缓冲液。
Bst 3.0 DNA 聚合酶随酶提供等温扩增缓冲液 II。
Phusion 超保真 DNA 聚合酶随酶提供 5X Phusion HF缓冲液、5X Phusion GC 缓冲液、DMSO 和 50 mMMgCl2。
1X ThermoPol 反应缓冲液:
20 mM Tris-HCl,10 mM KCl,10 mM (NH4)2SO4,2 mM MgSO4 和 0.1% Triton X-100,pH 8.8 @ 25℃。
1X 标准 Taq 反应缓冲液:
10 mM Tris-HCl,50 mM KCl,1.5 mM MgCl2,pH 8.3 @25℃。
1X 等温扩增缓冲液:
20 mM Tris-HCl,10 mM (NH4)2SO4,50 mM KCl,2 mM MgSO4,0.1% Tween-20,pH 8.8 @ 25℃。
1X 等温扩增缓冲液 II :
• 常用的 DNA 底物
500 μg/ml
31.5 x 106 Da/48,502 bp
Phusion 超保真 DNA 聚合酶随酶提供 5X Phusion HF 缓冲液、5X Phusion GC 缓冲液、DMSO 和 50mM MgCl2。
20 mM Tris-HCl,10 mM (NH4)2SO4,15 mM KCl,2 mM MgSO4,0.1% Tween-20,pH 8.8 @ 25℃。
Taq 、Vent、Deep Vent、Bst 全长、Bst 大片段、Sulfolobus IV 和 Therminator DNA 聚合酶都随酶提供
10X ThermoPol 反应缓冲液,该缓冲液稀释成终浓度为 1X 时含有 2 mM MgSO4。另外还有不含Mg2+的
10X ThermoPol 反应缓冲液,用于要求 Mg2+ 浓度低于 2 mM 的反应。
Taq DNA 聚合酶随酶提供标准 Taq 反应缓冲液,可以替换 ThermoPol 反应缓冲液。
Bst 2.0 和 Bst 2.0 WarmStart DNA 聚合酶都随酶提供等温扩增缓冲液。
Bst 3.0 DNA 聚合酶随酶提供等温扩增缓冲液 II。
Phusion 超保真 DNA 聚合酶随酶提供 5X Phusion HF缓冲液、5X Phusion GC 缓冲液、DMSO 和 50 mMMgCl2。
1X ThermoPol 反应缓冲液:
20 mM Tris-HCl,10 mM KCl,10 mM (NH4)2SO4,2 mM MgSO4 和 0.1% Triton X-100,pH 8.8 @ 25℃。
1X 标准 Taq 反应缓冲液:
10 mM Tris-HCl,50 mM KCl,1.5 mM MgCl2,pH 8.3 @25℃。
1X 等温扩增缓冲液:
20 mM Tris-HCl,10 mM (NH4)2SO4,50 mM KCl,2 mM MgSO4,0.1% Tween-20,pH 8.8 @ 25℃。
1X 等温扩增缓冲液 II :
• 单链病毒 DNA
1,000 μg/ml
1.7 x 106 Da/5,386 bases
Taq 、Vent、Deep Vent、Bst 全长、Bst 大片段、Sulfolobus IV 和 Therminator DNA 聚合酶都随酶提供
10X ThermoPol 反应缓冲液,该缓冲液稀释成终浓度为 1X 时含有 2 mM MgSO4。另外还有不含Mg2+的
10X ThermoPol 反应缓冲液,用于要求 Mg2+ 浓度低于 2 mM 的反应。
Taq DNA 聚合酶随酶提供标准 Taq 反应缓冲液,可以替换 ThermoPol 反应缓冲液。
Bst 2.0 和 Bst 2.0 WarmStart DNA 聚合酶都随酶提供等温扩增缓冲液。
Bst 3.0 DNA 聚合酶随酶提供等温扩增缓冲液 II。
Phusion 超保真 DNA 聚合酶随酶提供 5X Phusion HF缓冲液、5X Phusion GC 缓冲液、DMSO 和 50 mMMgCl2。
1X ThermoPol 反应缓冲液:
20 mM Tris-HCl,10 mM KCl,10 mM (NH4)2SO4,2 mM MgSO4 和 0.1% Triton X-100,pH 8.8 @ 25℃。
1X 标准 Taq 反应缓冲液:
10 mM Tris-HCl,50 mM KCl,1.5 mM MgCl2,pH 8.3 @25℃。
1X 等温扩增缓冲液:
20 mM Tris-HCl,10 mM (NH4)2SO4,50 mM KCl,2 mM MgSO4,0.1% Tween-20,pH 8.8 @ 25℃。
1X 等温扩增缓冲液 II :
1,000 μg/ml
1.75 x 106 Da/2,686 bp
含有 100 mM dATP,pH 7.4 的钠盐溶液。
acyNTP 可作为链终止基团,因而可用于一般采用 ddNTP 的实验,如 DNA 测序和 SNP 分析。acyNTP 尤其适用于古生菌 DNA 聚合酶的反应,特别是 Therminator DNA 聚合酶。Therminator DNA 聚合酶经过基因工程改造后,拥有更强的掺入核苷酸类似物的能力,这些类似物的糖环发生了改变,如 rNTP,ddNTP,2´ 脱氧核苷酸,特别是 acy 碱基类似物。
有关该产品特性和应用的上海金畔生物科技有限公司官网,NEB代理,订购热线:18301939375。
1 单位指 42℃ 条件下,1 小时消化 200 μl 低熔点琼脂糖或 NuSieve 琼脂糖生成可溶性新琼脂-寡糖所需的酶量。
经 β-琼脂糖酶 I处理后乙醇沉淀的琼脂糖量
1,000 units/ml。
HPLC 纯度≥99%
应用于不依赖连接的克隆(LIC)
本产品也在以下两种剂型中提供:dNTP 混合液(NEB #N0447)及 dNTP 套装(NEB #N0446)
dGTP 溶液为 100 mM 超纯 dGTP 的钠盐溶液,pH 7.5,共 0.25 ml,
稀释液
可使用无菌蒸馏水稀释,Milli-Q® 水稀释更佳,也可使用无菌 TE 稀释(10 mM Tris-HCl,1 mM EDTA(pH 7.5))稀释。
5,000 units/ml
TelN 端粒酶分离自 N15 噬菌体,其在 TelN识别序列(56 bp)切割 dsDNA,并在切割位点形成共价封闭末端。
1X ThermoPol 反应缓冲液,30℃ 温育。
1 单位指在 50μl 1X ThermoPol 反应缓冲液体系中,30℃ 条件下,30 分钟切割 0.5μg BsaI 线性化 pMiniT-TelN 对照质粒(313 fmol TelN 识别位点)所需要的酶量。
75°C 加热5分钟。
含有 100 mM dATP,pH 7.4 的钠盐溶液。
acyNTP 可作为链终止基团,因而可用于一般采用 ddNTP 的实验,如 DNA 测序和 SNP 分析。acyNTP 尤其适用于古生菌 DNA 聚合酶的反应,特别是 Therminator DNA 聚合酶。Therminator DNA 聚合酶经过基因工程改造后,拥有更强的掺入核苷酸类似物的能力,这些类似物的糖环发生了改变,如 rNTP,ddNTP,2´ 脱氧核苷酸,特别是 acy 碱基类似物。
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含有 100 mM dATP,pH 7.4 的钠盐溶液。
acyNTP 可作为链终止基团,因而可用于一般采用 ddNTP 的实验,如 DNA 测序和 SNP 分析。acyNTP 尤其适用于古生菌 DNA 聚合酶的反应,特别是 Therminator DNA 聚合酶。Therminator DNA 聚合酶经过基因工程改造后,拥有更强的掺入核苷酸类似物的能力,这些类似物的糖环发生了改变,如 rNTP,ddNTP,2´ 脱氧核苷酸,特别是 acy 碱基类似物。
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为了确保其最佳活性,长期保存请分装后存于 -80℃。
含有 100 mM dATP,pH 7.4 的钠盐溶液。
含有 100 mM dATP,pH 7.4 的钠盐溶液。
acyNTP 可作为链终止基团,因而可用于一般采用 ddNTP 的实验,如 DNA 测序和 SNP 分析。acyNTP 尤其适用于古生菌 DNA 聚合酶的反应,特别是 Therminator DNA 聚合酶。Therminator DNA 聚合酶经过基因工程改造后,拥有更强的掺入核苷酸类似物的能力,这些类似物的糖环发生了改变,如 rNTP,ddNTP,2´ 脱氧核苷酸,特别是 acy 碱基类似物。
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3´-Biotin-GTP can be used with the Vaccinia Capping System (NEB #M2080),to cap 5´ ends of tri- or di- phosphorylated RNA (1). This enables capture of the RNA 5´ ends using streptavidin.
Storage Temperature
-20°C
5´ -三磷酸腺苷(ATP): 浓度为 10mM
含有 100 mM dATP,pH 7.4 的钠盐溶液。
acyNTP 可作为链终止基团,因而可用于一般采用 ddNTP 的实验,如 DNA 测序和 SNP 分析。acyNTP 尤其适用于古生菌 DNA 聚合酶的反应,特别是 Therminator DNA 聚合酶。Therminator DNA 聚合酶经过基因工程改造后,拥有更强的掺入核苷酸类似物的能力,这些类似物的糖环发生了改变,如 rNTP,ddNTP,2´ 脱氧核苷酸,特别是 acy 碱基类似物。
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CYT-222
CSF-2, MGI-1GM, GM-CSF, Pluripoietin-alpha, CSF2, GMCSF
2. Analysis by RP-HPLC, using a calibrated solution of GM-CSF as a Reference Standard.
2.Title: Neospora caninum: cloning and expression of a gene coding for cytokine-inducing profilin.
Publication: Exp Parasitol. 2010 Aug;125:357-62. Epub 2010 Mar 6. PMID: 20211619
Link: http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S001448941000086X
Applications: Used for immunoblotting
3.Title: Intranasal Granulocyte-Macrophage Colony-Stimulating Factor Reduces the Aspergillus Burden in an Immunosuppressed Murine Model of Pulmonary Aspergillosis.
Publication: Antimicrob Agents Chemother. 2008 February; 52: 716–718.
Published online 2007 November 5
Link: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2224773/?tool=pmcentrez
Applications: GM-CSF as tested a therapeutic potential in a murine model of pulmonary aspergillosis. In summary, this pilot study indicates that GM-CSF administered intranasally may be a novel therapeutic approach for the prevention or treatment of pulmonary fungal infections and may augment the efficacies of antifungal agents.
GM-CSF was given intranasal.
4.Title: Dendritic Cell-Based Therapeutic Vaccination against Myeloma: Vaccine Formulation Determines Efficacy against Light Chain Myeloma
Publication: The Journal of Immunology February 1, 2009 vol. 182 no. 3 1667-1673
Link:
http://www.jimmunol.org/content/182/3/1667.full
5.Title:Pre-clinical Evaluation of a CEA DNA Prime/protein Boost Vaccination Strategy Against Colorectal Cancer.
Publication:Article first published online: 21 JUN 2007 DOI:10.1111/j.1365-3083.2007.01945.x
6.Title:Intranasal Granulocyte-Macrophage Colony-Stimulating Factor Reduces the Aspergillus Burden in an Immunosuppressed Murine Model of Pulmonary Aspergillosis.
Publication: First published November 2007, doi: 10.1128/?AAC.00760-07 Antimicrob. Agents Chemother. February 2008 vol. 52 no. 2 716-718
Link:http://aac.asm.org/content/52/2/716.full
CYT-687
CTGF filtered solution in 0.1M Citrate buffer pH 4.7 and 20% glycerol.
CYT-325
CYT-201
Erythropoietin-Alpha, EPO-a, EPO-alpha, EP, MGC138142.
It is recommended to reconstitute the lyophilized EPO-alpha in sterile 18MΩ-cm H2O not less than 100µg/ml, which can then be further diluted to other aqueous solutions.
1.Title:Zinc Transporters ZnT1 , Zip8 , and Zip10 in Mouse Red Blood Cells Are Differentially Regulated during Erythroid Development and by Dietary Zinc Deficiency1–3
Publication:Journal of Nutrition, doi:10.3945/jn.108.093575
Vol. 138, No. 11, 2076-2083, November 2008
© 2008 American Society for Nutrition J. Nutr. 138:2076-2083, November 2008
Link:http://jn.nutrition.org/content/138/11/2076.full
2.Title:Systemically delivered Erythropoietin transiently enhances adult hippocampal neurogenesis.
Publication:Article first published online: 7 MAY 2007 DOI:10.1111/j.1471-4159.2007.04684.x Journal of Neurochemistry Volume 102, Issue 6, pages 1953–1965, September 2007.
Link:http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/j.1471-4159.2007.04684.x/full
3.Title:ZINC TRANSPORTER EXPRESSION IN MATURE RED BLOOD CELLS AND
DIFFERENTIATING ERYTHROID PROGENITOR CELLS.
Publication:UNIVERSITY OF FLORIDA
© 2007 Moon-Suhn Ryu
Link:http://ufdcimages.uflib.ufl.edu/UF/E0/02/14/46/00001/ryu_m.pdf
4.Title:Cell Therapy with Human Renal Cell Cultures Containing Erythropoietin-Positive Cells Improves Chronic Kidney Injury.
Publication:First Published Online May 3, 2012 doi: 10.5966/sctm.2011-0048 Stem Cells Trans Med May 2012 vol. 1 no. 5 373-383
Link:http://stemcellstm.alphamedpress.org/content/1/5/373.full