美国Zymo Research公司快速DNA甲基化试剂盒 EZ DNA Methlyation-Lightning Kit (D5031)

EZ DNA Methylation-Lightning™ Kit能够快速高效的进行DNA转化,进行甲基化分析,其特点是速度快,无需准备,直接将特异试剂加入DNA,大约1h既可完成反应。DNA变性和亚硫酸氢盐的转化过程结合了额外的热量,以促进快速变性。利用独特的低洗脱纯化柱对转化的DNA进行脱硫和纯化。高产量,转化的DNA可用于PCR,芯片及二代测序等。

美国Zymo Research公司快速DNA甲基化试剂盒 EZ DNA Methlyation-Lightning Kit (D5031)

特点:

1.    DNA起始量:100pg-2ug DNA起始;起始量200-500ng效果最理想

2.    转化效率:>99.5%的非甲基化胞嘧啶转化成U,>99.5%的甲基化胞嘧啶被保护不被转化

3.    DNA回收率:>80%

4.    操作时间:1.5h

5.    样本类型:纯化的DNA,酶切的DNA,线性质粒DNA等,需要高质量DNA,无RNA污染

6.    洗脱体积:≥10ul

NEB代理,限制性内切酶,用于表观遗传学甲基化敏感性内切酶,AbaSI#R0665S

产品资料 – 限制性内切酶 – 用于表观遗传学甲基化敏感性内切酶

AbaSI

#R0665S 1,000 units

识别位点

NEB代理 , 限制性内切酶 , 用于表观遗传学甲基化敏感性内切酶

特性

 重组酶,EpiMark 验证

概述

 AbaSl 是一种 DNA 修饰依赖型核酸内切酶, 能够识别双链 DNA 中的 5-葡糖基羟甲基胞嘧啶
(ghmC),并能在距修饰的胞嘧啶 3´ 侧 11-13 碱基处进行切割,形成一个 2-3 碱基的 3´ 突出末端。该酶只有在距修饰的胞嘧啶 3´ 侧 20-23 核苷酸处有一个鸟嘌呤基团存在时,才可以切割。AbaSl 也识别 5-羟甲基胞嘧啶(hmC),但效率较低;不识别 5-甲基胞嘧啶(mC)或未修饰的胞嘧啶。

反应条件

:1X CutSmart 缓冲液,25℃ 温育。

热失活: 65℃ 20 分钟。

浓度

10,000 units/ml。

NEB代理 , 限制性内切酶 , 用于表观遗传学甲基化敏感性内切酶,DpnI星选酶#R0176L

产品资料 – 限制性内切酶 – 用于表观遗传学甲基化敏感性内切酶

DpnI(星选酶)

#R0176L 5,000 units

#R0176S 1,000 units

#R0176V 500 units  

识别位点

NEB代理 , 限制性内切酶 , 用于表观遗传学甲基化敏感性内切酶

在不同反应缓冲液的活性

NEBuffer 1.1: 100%
NEBuffer 2.1: 100%
NEBuffer 3.1: 75%
CutSmart Buffer: 100%

特性

CutSmart、重组酶、EpiMark 验证、省时酶。

反应条件

CutSmart 缓冲液,37℃。
热失活:80℃ 20 分钟。

浓度

20,000 units/ml。

甲基化敏感性

只有当识别位点被甲基化时,Dpnl 才能切割。从 dam+ 菌株纯化而来的 DNA 才是Dpnl 切割的底物。对哺乳动物基因组 DNA CpG 甲基化敏感。

NEB代理 , 限制性内切酶 , 用于表观遗传学甲基化敏感性内切酶,FspEI#R0662S

产品资料 – 限制性内切酶 – 用于表观遗传学甲基化敏感性内切酶

FspEI

#R0662S 200 units  

识别位点

NEB代理 , 限制性内切酶 , 用于表观遗传学甲基化敏感性内切酶

特性

重组酶,EpiMark 验证

概述

FspEl 是经 EpiMark 验证过的产品,是一种修饰依赖型核酸内切酶,能够识别 CmC 位点并能在修饰的胞嘧啶 3´ 侧 N12/N16 处切割双链 DNA。能被识别的胞嘧啶修饰包括:C5-甲基化胞嘧啶(5-mC)和 C5-羟甲基化胞嘧啶(5-hmC)。

反应条件

1X CutSmart 缓冲液 + 1X 酶活性液,37℃ 温育。
热失活:80℃ 20 分钟。

浓度

5,000 units/ml。

注意事项

延长酶切时间可能会出现星号活性。

NEB代理 , 限制性内切酶 , 用于表观遗传学甲基化敏感性内切酶,LpnPI#R0663S

产品资料 – 限制性内切酶 – 用于表观遗传学甲基化敏感性内切酶

LpnPI

#R0663S 200 units

识别位点

NEB代理 , 限制性内切酶 , 用于表观遗传学甲基化敏感性内切酶

特性

重组酶,EpiMark 验证

概述

LpnPl 是经 EpiMark 验证过的产品,是一种修饰依赖型核酸内切酶,能够识别 CmCDG 位点并能在修饰的胞嘧啶 3´ 一侧 N10/N14 处切割双链 DNA。能识别的胞嘧啶修饰有:C5-甲基化胞嘧啶(5-mC)和 C5-羟甲基化胞嘧啶(5-hmC)。

反应条件

1X NEBuffer 4 + BSA + 1X 酶活性液,37℃ 温育。
热失活:65℃ 20 分钟。

浓度

5,000 units/ml。

注意事项

延长酶切时间可能会出现星号活性。

NEB代理 , 限制性内切酶 , 用于表观遗传学甲基化敏感性内切酶,MspJI#R0661L

产品资料 – 限制性内切酶 – 用于表观遗传学甲基化敏感性内切酶

MspJI

#R0661L 1,000 units

#R0661S 200 units

识别位点

NEB代理 , 限制性内切酶 , 用于表观遗传学甲基化敏感性内切酶

特性

重组酶,EpiMark 验证

特性

MspJl 是经 EpiMark 验证过的产品,是一种修饰依赖型核酸内切酶,能够识别 mCNNR 位点并能在修饰的胞嘧啶 3´ 一侧 N9/N13 处切割双链 DNA。能被识别的胞嘧啶修饰有:C5-甲基化胞嘧啶(5–mC)和 C5-羟甲基化胞嘧啶(5-hmC)。

反应条件

1X NEBuffer 4 + BSA + 1X 酶活性液,37℃ 温育。
热失活:65℃ 20 分钟。

浓度

5,000 units/ml。

注意事项

延长酶切时间可能会出现星号活性。

NEB代理,限制性内切酶,用于表观遗传学甲基化敏感性内切酶,McrBC#M0272L

产品资料 – 限制性内切酶 – 用于表观遗传学甲基化敏感性内切酶

McrBC

#M0272L 2,500 units

#M0272S 500 units

识别位点

NEB代理 , 限制性内切酶 , 用于表观遗传学甲基化敏感性内切酶

特性

 测定 CpG 二核苷酸的甲基化状态
 测定胞嘧啶甲基化的 DNA
NEB代理 , 限制性内切酶 , 用于表观遗传学甲基化敏感性内切酶
与 McrBC 一起温育的人类和果蝇基因组 DNA。在脊椎动物中估计有 60-90% 的 CpGs 是被甲基化的(6),而果蝇 DNA 中甲基化的 CpGs 非常稀少(大约 12.5 kb 的 DNA 中仅出现一个甲基胞嘧啶,7)。泳道 1:人类 DNA;泳道 2:与 McrBC 一起温育的人类 DNA;泳道 3:果蝇DNA;泳道 4:与 McrBC 一起温育的果蝇 DNA;泳道 M:BstEII 消化的 λDNA(NEB #N3014)。

概述

McrBC 是一种核酸内切酶,无论甲基胞嘧啶*是在 DNA 的一侧链上还是在对侧链上,McrBC都能切割。对未甲基化的 DNA,McrBC 无作用。DNA 上 McrBC 的识别位点由两个 (G/A)mC 形式的半位点组成,这两个半位点之间的距离可以达到 3 kb,但是最佳距离为 55-103 bp。McrBC 的切割需要 GTP,当存在不可水解的 GTP 类似物时,该酶可以特异地结合到甲基化 DNA 上,但不能进行切割。McrBC 作用于一对 PumCG 序列元件,以此检测高比例甲基化的 CpGs,但是不能识别内部胞嘧啶甲基化了的 HpaII/MspI 位点(CCGG)。
* 5-甲基胞嘧啶、5-羟甲基胞嘧啶或者 N4-甲基胞嘧啶。

来源

两种组成蛋白分别纯化自含有编码 McrB和 McrC 质粒的 E.coli K-12 菌株。

反应条件

NEBuffer 2 + BSA + GTP,37℃ 温育。
热失活:65℃ 20 分钟。

随酶提供的试剂

10X NEBuffer 2
100X BSA
100X GTP (100 mM)
对照质粒 DNA

单位定义

1 单位指在 50 μl 反应体系中,37℃ 条件下,1 小时切割 0.5 μg 含有多个 McrBC 位点的质粒所需要的酶量。

浓度

10,000 units/ml。

注意事项

McrBC 在每对半位点之间切割一次,切割位点靠近某一个半位点,但是通常距最近的甲基化碱基大约 30 bp。因此,当 DNA 中存在多个 McrBC 半位点时(例如胞嘧啶甲基化基因组DNA),识别序列的可变性导致位点重叠,产生弥散状而不是细窄的条带。

上海金畔生物科技有限公司官网,NEB代理,订购热线:18301939375

有关该产品性质和应用的上海金畔生物科技有限公司官网,NEB代理,订购热线:18301939375。