NEB代理,DNA聚合酶与扩增技术,等温扩增和链置换,WarmStart® 变色 LAMP/RT-LAMP 2X 预混液,含 UDG,#M1804L

产品资料 – DNA聚合酶与扩增技术 – 等温扩增和链置换

WarmStart® 变色 LAMP/RT-LAMP 2X 预混液(含 UDG)

#M1804L 500 rxns

#M1804S 100 rxns

特性

     一步法环介导的等温扩增(LAMP)的便捷解决方案,可用于 DNA RNA 样品检测。

·   扩增反应快速,反应体系由粉红色变为黄色,使检测结果清晰可视化

·   预混液包含 UDG dUTP,杜绝残留污染风险

·   WarmStart ®的温启动性能在室温下抑制酶活性,可轻松在室温条件下建立反应体系

·   如需了解 LAMP 及等温扩增的更多信息,请点击Learn more

·   如需了解 LAMP 变色反应在 COVID-19 中的应用,请点击Learn how

NEB代理 , DNA聚合酶与扩增技术 , 等温扩增和链置换

       阴性结果显示粉红色,阳性结果显示变为黄色

概述

 含 UDG WarmStart® LAMP 变色预混液是由 Bst 2.0 WarmStart DNA 聚合酶和 WarmStart® RTx 反转录酶在特殊的低缓冲力反应溶液中优化形成,该溶液包含可视化的 pH 指示剂,使检测 LAMP RT-LAMP 的结果判定更加简单、快捷。预混液中包含的 dUTP UDG 可有效减少反应间的残留污染。

该系统提供了一种快速、清晰可视化的扩增检测方案,其原理为 DNA 聚合酶在 LAMP 扩增反应中产生大量质子,引发 pH 值的下降,从而使反应液颜色从粉红色变为黄色(如需了解 LAMP 概述和引物设计,请观看 NEB 网站相关视频)。该预混液即可用于 LAMP 也可用于 RT-LAMP 反应,仅需加热装置及样品,即可在 15-40 分钟内肉眼判定阳性结果。

简单可视化的扩增检测

NEB代理,LyoPrime Luna™ 探针一步法 RT-qPCR 预混冻干粉,含 UDG,#L4001S

产品资料 – DNA聚合酶与扩增技术 – qPCR & RT-qPCR

LyoPrime Luna™ 探针一步法 RT-qPCR 预混冻干粉(含 UDG)

#L4001S 120 reactions

产品特点

 LyoPrime Luna 探针一步法 RT-qPCR 预混冻干粉(含 UDG)用于灵敏检测靶标 RNA,可在室温条件下稳定保存。该冻干剂型与其液体剂型 [ Luna® 探针一步法 RT-qPCR 4X 预混液(含 UDG)(NEB #M3019)] 具备同样卓越的性能和功效。

· 加入无核酸酶水即可快速复溶

· 未经复溶的冻干试剂,可室温储存长达 2 年

· 无需冷链运输

· 单次检测通量多达 5 个靶标

· Luna 温启动反转录酶与 Taq 热启动 DNA 聚合酶联合使用,提高反应特异性及功效

· 优化的预混试剂中包含热敏 UDG 和 dUTP,防止模板残留污染

· 预混试剂还含有小鼠 RNase 抑制剂,可保持 RNA 的完整性

· 非荧光蓝色示踪染料避免加样错误

· 与多种 qPCR 仪器兼容,包括需要高 ROX 或低 ROX 参比信号的仪器

· New England Biolabs(简称 NEB) 和 Fluorogenics Limited(现为 NEB 的子公司)联合开发

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产品信息

 LyoPrime Luna™ 探针一步法 RT-qPCR 预混冻干粉(含 UDG)可在室温条件下运输和保存。仅需加入无核酶水即可快速复溶并使用。该产品适用于水解探针法实时检测靶标 RNA。经优化可同时对高达 5 个靶标进行灵敏、线性的多重检测。稳定的冻干剂型可复溶成 2X 或 4X 浓度的预混液,以满足各种上样需求。

1LyoPrime Luna 为冻干型通用 RT-qPCR 试剂,其性能卓越并可稳定保存

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LyoPrime Luna RT-qPCR 预混冻干粉(NEB #L4001)与 Luna RT-qPCR 4X 预混液(NEB #M3019)具备相同的性能,该冻干剂型可在室温条件下运输和保存。

该预混冻干粉包含一步法 RT-qPCR 需要的所有组分,优化的缓冲液中含有 Luna 温启动反转录酶、Taq 热启动 DNA 聚合酶、dNTPs 和小鼠 RNase 抑制剂。Taq 热启动 DNA 聚合酶与新型温启动反转录酶联合使用,可通过基于适配体的可逆抑制来双重控制酶的活性。这种温控活化机制可避免热循环前的非特异扩增,可在复溶后室温建立体系。经基因工程改造的 Luna 温启动反转录酶具有更高的热稳定性,最佳反应温度为 55°C。此外,预混试剂中还添加了独特矫正染料,可与多种 qPCR 仪器兼容,包括需要高 ROX 或低 ROX 参比信号的仪器。
 
由于 RT-qPCR 灵敏度极高,因此避免 DNA 污染至关重要。该试剂含有热敏 UDG 和 dUTP,可防止模板残留污染(以往的扩增产物可作为后续反应的底物)。与 E.coli UDG 不同的是,热敏 UDG 在温度>50℃时可完全失活,因此对反应没有影响。
 
试剂包含非荧光蓝色示踪染料,可避免加样错误。该示踪染料与 qPCR 常用荧光基团的光谱没有重叠,也不会干扰实时检测。
 
了解冻干工艺,或咨询定制服务以满足实验需求,请访问 www.neb.com/lyoprime。

 图 2:冻干型和液体型 Luna RT-qPCR 预混试剂具备同样优异的性能

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A. 使用 LyoPrime Luna 探针一步法 RT-qPCR 预混冻干粉(含 UDG)(NEB #L4001) 或 Luna® 探针一步法 RT-qPCR 4X 预混液(含 UDG)(NEB #M3019) 对人 β-actin 靶标进行 RT-qPCR 检测,模板上样量为 8-log 浓度梯度(1 μg–0.1 pg Jurkat 总 RNA),每个浓度重复 4 次,使用 ABI® QuantStudio 6 Flex 仪器运行试验。反应体系(20 μl)中,引物浓度为 400 nM,探针浓度为 200 nM,反应设置为产品推荐的循环条件。B. 冻干试剂(金色)和液体试剂(蓝色)的标准曲线基本相同,即使在最低测试浓度下也展现出良好的线性度和重复性。

图 3:LyoPrime Luna 多重检测性能卓越

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 使用 LyoPrime Luna 探针一步法 RT-qPCR 预混冻干粉(含 UDG)对 6-log 浓度梯度的 Jurkat 总 RNA(1 μg-10 pg)进行多重 RT-qPCR,实验仪器为 Bio-Rad CFX96 荧光定量仪。结果显示了 5 个人源靶基因的扩增标准曲线和扩增效率。反应体系(20 μl)中,引物和探针浓度均为 200 nM,反应设置为产品推荐的循环条件。在该多重反应中,5 个靶标均检测到良好的线性度、扩增效率和 R2 值。

图 4:LyoPrime Luna 冻干剂型与其液体剂型性能一致,且优于其它品牌

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两位实验人员按照操作说明书,使用市售冻干 RT-qPCR 试剂分别对 8 个不同丰度、长度和 GC 含量的靶标(通过不同颜色显示)进行一步法 RT-qPCR 测试。反应结果就以下方面进行评估:扩增效率、低样品量检测能力及无模板扩增值(ΔCq=无模板对照的平均 Cq-最低起始量的平均 Cq)。此外,还评估了扩增结果的一致性、可重复性和总体曲线质量。结果显示:LyoPrime Luna™ 探针一步法 RT-qPCR 预混冻干粉(含 UDG)(NEB #L4001)与其液体剂型 Luna® 探针一步法 RT-qPCR 4X 预混液(含 UDG)(NEB #M3019)性能一致,且优于其它冻干产品,
 
了解 qPCR/RT-qPCR 综合测试和“dots in boxes”点阵图分析方法,请点击https://www.neb.com/tools-and-resources/video-library/dots-in-boxes-visualization-of-qpcr-data
图 5:冻干型和液体型 Luna 试剂均可对 SARS-CoV-2 病毒 RNA 进行灵敏检测
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本实验使用 Luna SARS-CoV-2 多重 RT-qPCR 检测试剂盒(NEB #E3019)中的引物和探针对 2019-nCoV_N1(N1, HEX)、2019-nCoV_N2(N2, FAM)和人源 RNase P(RP, Cy5)进行多重 RT-qPCR 检测,实验仪器为 Bio-Rad® CFX384 荧光定量仪。反应体系(5 μl)中,引物浓度为 400 nM,探针浓度为 200 nM,反应设置为产品推荐的循环条件。实验样品:将 Twist 公司合成的 SARS-CoV-2 RNA 对照 2 掺入到 5 ng/μl Jurkat 总 RNA 中。LyoPrime Luna RT-qPCR 冻干剂型与其液体剂型均展示出良好的线性定量能力(对于 5 和 10 拷贝的 SARS-CoV-2 RNA,N1 和 N2 基因 40 个重复的检出率为 100%,28 个阴性对照重复均无假阳性)。在 96 孔板中测试的 20 μl 体系结果相同。
 
图 6:LyoPrime Luna 试剂可对不同传染病靶标进行检测和定量
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分别使用病毒 RNA 基因(FAM)和人源 RNase P(Cy5)靶标的引物和探针进行 RT-qPCR 实验,实验仪器为 Bio-Rad CFX96 荧光定量仪。试验样品:将 100,000-10 拷贝的 ATCC® 合成病毒 RNA(基孔肯雅病毒:VR-3246SD;2 型登革热病毒:VR-3229SD;寨卡病毒:VR-3252SD)掺入到 5 ng/μl 人源(Jurkat)总 RNA 中。每个靶标使用其对应的 ATCC 参考引物和探针序列。反应体系(20 μl)中,引物浓度为 400 nM,探针浓度为 200 nM,反应设置为产品推荐的循环条件。结果显示:LyoPrime Luna RT-qPCR 预混冻干粉对于所有靶标的线性定量和检测结果均非常理想。

NEB代理,Luna® 探针一步法 RT-qPCR 4X 预混液,含 UDG,#M3019E

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Luna® 探针一步法 RT-qPCR 4X 预混液(含 UDG)

#M3019E 2000 rxns

#M3019L 500 rxns

#M3019S 200 rxns

#M3019X 1000 rxns

特性

 Luna 通用探针一步法 RT-qPCR 4X 预混液,含 UDG 可精准检测目标 RNA,多重扩增检测性能优异,一次可检测多达 5 个靶标。

 

 •  单管预混液剂型使反应体系的建立更便捷

   4X 浓度的预混液可增加样品加入量,提高 RT-qPCR 灵敏度

   一次可检测多达 5 个靶标,增加检测通量

   Luna 温启动反转录酶与 Taq 热启动 DNA 聚合酶联合使用,提高反应特异性及稳定性并可室温建立体系

 •  预混液中包含 UDG dUTP防止模板残留污染

 •  无干扰的可见示踪染料避免加样错误

 •  点击 COVID-19 research 了解 NEB 如何将多种 RT-qPCR 病毒检测方法用于新冠研究

产品说明

  Luna 通用探针一步法 RT-qPCR 4X 预混液,含 UDG 用于探针法实时荧光定量检测靶标 RNA。首先反转录酶将 RNA 转化为 cDNA,然后 DNA 聚合酶对 cDNA 进行扩增,完成靶标的实时荧光定量 PCR(qPCR),整个过程在单管内一次性完成。基于探针法的 qPCR / RT-qPCR 原理是利用聚合酶的 5´ → 3´ 外切酶活性,将淬灭的目标特异性探针切断发出荧光,并实时监测荧光值的增加,以测量每个循环中的 DNA 扩增。在荧光信号显著超过背景荧光的位置,可以确定 Cq 值。Cq 值可用于评估两个或多个样品的靶基因相对丰度。

 
该预混液基于探针法化学原理,采用一步法 RT-qPCR 流程,因此可与 Luna 通用探针一步法 RT-qPCR 试剂盒(NEB #E3006)进行对比
 1:用于一步法 RT-qPCR 实验的新产品
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Luna 通用探针一步法 RT-qPCR 预混液,含 UDG 为 4X 浓度,因此在靶标 RNA 量极低的应用中(例如:病原体检测),可提高样品加入量。通过对 个靶标进行不同浓度的线性、灵敏度检测,显示该产品在多重检测中性能更优。该预混液将一步法 RT-qPCR 所需组分整合到单个试管中,包括:Luna 温启动反转录酶、Taq 热启动 DNA 聚合酶、dNTP 和小鼠 RNase 抑制剂。Taq 热启动 DNA聚合酶与新型温启动反转录酶联合使用,可通过基于适配体的可逆抑制来双重控制酶的活性。这种温控活化机制可避免热循环前的非特异扩增,从而让室温建立体系更安全。经改造的 Luna 温启动反转录酶具有更高的热稳定性,最佳反应温度为 55°C。此外,预混液还添加了独特矫对染料,可与多种 qPCR 仪器兼容,包括需要高 ROX 或低 ROX 参比信号的仪器。
 
图 2:使用 Luna 通用探针一步法 RT-qPCR 4X 预混液,含 UDG 对不同 RNA 病毒进行检测显示性能卓越
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使用 Luna 通用探针一步法 RT-qPCR 4X 预混液,含 UDG 对 SARS-CoV-2N1)和流感病毒 H1N1HA)进行  RT-qPCR。反应体系为 20 ul,对 5-log 浓度梯度样品进行扩增性能评估,使用两台荧光定量仪器进行平行测试。(A10–100,000 拷贝合成 SARS-CoV-2 RNA 对照 2Twist BiosciencesSKU102024)溶于 10 ng Jurkat 总 RNA 中(BioChain,#R1255815-50)。(B12.4–124,000 拷贝甲型流感病毒(H1N1RNAATCC®VR-95DQ)溶于 10 ng Jurkat 总 RNA 中。结果显示两个病毒靶标扩增的灵敏度和线性度都很理想。
图 3:使用 Luna 通用探针一步法 RT-qPCR 4X 预混液,含 UDG 进行多重检测(个靶标)
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使用 Luna 通用探针一步法 RT-qPCR 4X 预混液,含 UDG 对 5-log 浓度梯度的 Jurkat 总 RNA100 ng-10 pg)进行多重 RT-qPCR,实验仪器为 Bio-Rad CFX96 荧光定量仪。结果显示了 个人源靶基因的扩增标准曲线和扩增效率。反应体系(20 μl)中引物和探针浓度均为 200 nM,反应设置为产品推荐的循环条件。在该多重反应中,个靶标均检测到良好的线性度、扩增效率和 R2 值。
 4Luna 通用探针一步法 RT-qPCR 4X 预混液,含 UDG 性能优于其它品牌
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两位实验人员按照操作说明书,在几天的时间内,使用 Applied Biosystems™ QuantStudio™ 6 实时 PCR 系统,用两种荧光定量试剂盒分别对 8 个不同丰度、长度和 GC 含量的靶标(通过不同颜色显示)进行一步法 RT-qPCR 测试。反应结果就以下方面进行评估:扩增效率、低样品量检测能力及无模板扩增值(ΔCq=无模板对照的平均 Cq-最低起始量的平均 Cq)。此外,基于前面的度量值(质量得分)还评估了扩增结果的一致性、可重复性和总体曲线质量。结果显示:参与测试的两种试剂均表现不错,但 NEB 测试结果落在绿框里的数量更多,因此 Luna 通用探针一步法 RT-qPCR 4X 预混液,含 UDG 性能优于 TaqPath 1-Step RT-qPCR预混液。

 

RT-qPCR 的高灵敏度使得避免 DNA 污染尤为重要。由于先前扩增产物可作为后续反应的底物,因此反应体系加入 dUTP 和热敏 UDG 可防止模板残留污染。热敏 UDG 超过50°C时会完全失活,因此对 qPCR 性能没有影响。

图 5RT-qPCR 避免模板残留污染的评估
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为了评估不同试剂盒对去除模板残留物的能力,首先使用 Luna 通用探针一步法 RT-qPCR 试剂盒制备含 U RT-qPCR 产物。然后使用三种不同的 RT-qPCR 预混液(均包含 UDG),将~105 拷贝的含 U 产物作为模板进行 qPCR。按照各品牌的操作说明,在第二个反应开始时进行 25°C 孵育使 UDG 降解含 dU 样品,以降低其产生(假)阳性信号的能力。ΔCq 是进行残留处理及未处理的循环数的差值。ΔCq 值越大说明去除残留产物的效率越高。使用 Luna 预混液去除污染后,一个样品中含 U 产物完全消化,另一个样品 ΔCq 较大。注意:在真实污染案例中,污染的 DNA 量很难评估/预测。

该预混液包含无荧光的可见蓝色示踪染料,有助于透明管加样。该示踪染料与 qPCR 常用荧光基团的光谱没有重叠,也不会干扰实时检测。

Luna 通用探针一步法 RT-qPCR 4X 预混液,含 UDG 包含无干扰的可见蓝色示踪染料可避免加样错误

 

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