· 用于从组织、细菌和其它样品（酵母、昆虫、两栖动物）中提取高分子量 DNA
· 从软组织和细菌中提取纯化的 DNA 片段大小达到 Mb 范围
· 对于一些样品，通过改变裂解过程中的离心速度，调节提取 DNA 的片段大小
· 操作流程简单、便捷（组织和细菌样品 90 分钟）
· 获得的 DNA 产量、纯度和完整性极佳
· 快速、高效的洗脱
· 是长片段测序的理想选择
· 包含 RNase A 和蛋白酶 K，以及微管研棒便于样品匀浆
Monarch® 高分子量 DNA 提取试剂盒（组织）为从组织、细菌及其它样品（包含酵母、昆虫和两栖动物）中提取完整的高分子量（HMW）gDNA 提供了快速的操作流程。针对于组织的提取方案为：首先使用研棒匀浆和蛋白酶 K 搅拌裂解样品，然后进行蛋白质去除，并将提取的 DNA 附着到大玻璃珠的表面。如果提取样品为细菌，则需要在蛋白酶 K 消化之前，使用溶菌酶对细菌细胞壁进行充分裂解。根据标准流程提取的 DNA 在 50-250 kb 之间，如果将离心速度降到最低，提取的 DNA 片段可达 Mb 范围。纯化后的 DNA 产量和纯度极高，且几乎完全不含 RNA。组织和细菌样品提取时间为 90 分钟。组织和细菌 A260 / A280 检测纯度为 1.8-1.9，组织 260/230 检测纯度为 2.1-2.5，细菌 260/230 检测纯度为 2.1-2.2。纯化后的 HMW DNA 适用于多种下游应用，包括长片段测序（Oxford NanoporeTechnologies®和 PacificBiosciences®），光学图谱（BionanoGenomics®）和 Linked-Reads 基因组组装。
图 1：使用 Monarch 高分子量 DNA 提取试剂盒从组织中提取纯化 HMW DNA 的操作流程
图 2：Monarch 高分子量 DNA 提取试剂盒（组织）可从多种样品中高效提取纯化高质量的 HMW DNA
使用 Monarch 高分子量 DNA 提取试剂盒（组织）提取 HMW 基因组 DNA。提取样品为：冻存大鼠肾脏 10 mg、新鲜小鼠肝脏 10 mg、冻存小鼠大脑 20 mg、新鲜小鼠肌肉 20 mg、冻存大肠杆菌 2 x 109、蜡样芽孢杆菌 2 x 108、新鲜非洲爪蟾 4 mg、新鲜酿酒酵母 3.8 x 108 和冻存埃及埃及斑蚊 15 mg。参照试剂盒说明书操作，离心速度为 2000 rpm。酿酒酵母使用经调整的操作流程。从平行实验样本中分别取 500 ng DNA 产物通过 PFGE 分离（在 BioRad® CHEF-DR® III 系统上，使用 1％ 琼脂糖凝胶，6 V / cm，13℃ 电泳 20 小时，切换时间为 0.5-94 秒）。各样品的产量和纯度见下表标注。分子量标准为 Lambda PFG Ladder（NEB＃N0341）。
图 3：在从组织和细菌中提取 HMW 基因组 DNA 的裂解过程中，使用不同的离心速度可调节提取片段长度
使用 Monarch 高分子量 DNA 提取试剂盒（组织）提取纯化 HMW 基因组，测试样品为小鼠肾脏（10 mg，图 3A）和大肠杆菌 NEB10 beta（1 x 109 细胞，图 3B）。在裂解步骤中，按照图中标注的速度离心样品，以控制 DNA 的片段化。从平行实验样本中取等量的 DNA 产物（小鼠肾脏：300 ng；大肠杆菌：500 ng）通过 PFGE 分离（在 BioRad® CHEF-DR® III 系统上，使用 1％ 琼脂糖凝胶，6 V / cm，13℃ 电泳 20 小时，切换时间为 0.5-94 秒）。分子量标准为 Lambda PFG Ladder（NEB＃N0341）。各样品的产量、纯度和 DIN 值见下表标注。
