分类: DNA聚合与技术NEB
NEB代理,WarmStart® 荧光 LAMP/RT-LAMP 试剂盒-含 UDG, #E1708L
WarmStart® 荧光 LAMP/RT-LAMP 试剂盒(含 UDG)
#E1708L 500 rxns
#E1708S 100 rxns
产品特点
设计 LAMP 引物,请使用 NEB LAMP Primer Design Tool
产品描述
WarmStart 荧光 LAMP/RT-LAMP 试剂盒(含 UDG)为 LAMP/RT-LAMP 的实时荧光检测提供了便捷的一步法解决方案。LAMP 和 RT-LAMP 是一种常用等温扩增技术,通过使用 LAMP 特异性引物(用户自备)和链置换 DNA 聚合酶进行靶标核酸的快速检测。该试剂盒包含的 WarmStart 通用 LAMP/RT-LAMP 2X 预混液(含 UDG)(NEB #M1708),是在优化后 LAMP 缓冲液中混入了 Bst 2.0 WarmStart DNA 聚合酶和 WarmStart RTx 反转录酶。Bst 2.0 WarmStart DNA 聚合酶和 WarmStart RTx 反转录酶均经过基因工程改造,提高了在 LAMP 和 RT-LAMP 反应中的性能。试剂盒还提供 50X LAMP 荧光染料,用于实时荧光检测。
NEB代理,DNA聚合酶与扩增技术,等温扩增和链置换,IsoAmp® II 通用 tHDA 试剂盒,#H0110S
IsoAmp® II 通用 tHDA 试剂盒
#H0110S 50 次反应
特性
概述
IsoAmp II 通用 tHDA 试剂盒基于第二代的热解旋酶扩增平台。此试剂盒提供 tHDA,反转录 HAD(RTHAD),实时定量 HAD(qHDA)和实时定量 RTHAD(qRT-HAD),所有反应都采用同一种反应缓冲液。
IsoAmp II 通用 tHDA 试剂盒组成
– 对照模板和扩增引物
NEB代理,DNA聚合酶与扩增技术,等温扩增和链置换,phi29 DNA 聚合酶,#M0269L
phi29 DNA 聚合酶
#M0269L 1,250 units
#M0269S 250 units
特性
概述
来源
浓度
10,000 units/ml。
热失活
65℃ 10 分钟。
上海金畔生物科技有限公司官网,NEB代理,订购热线:18301939375
NEB代理 , DNA聚合酶与扩增技术 , 等温扩增和链置换,Bst DNA 聚合酶,#M0275L
Bst DNA 聚合酶,大片段
#M0275L 8,000 units
#M0275M(高浓度15X)8,000 units
#M0275S 1,600 units
#M0275V 800 units
特性
可用于要求嗜温链置换的实验
概述
来源
浓度
8,000 和 120,000 units/ml。
热失活
80℃ 20 分钟。
使用注意
上海金畔生物科技有限公司官网,NEB代理,订购热线:18301939375
有关该产品特性和应用的上海金畔生物科技有限公司官网,NEB代理,订购热线:18301939375。
NEB代理,DNA聚合酶与扩增技术,等温扩增和链置换,Bst DNA 聚合酶,#M0328S
Bst DNA 聚合酶,全长
#M0328S 500 units
特性
概述
来源
浓度
5,000 units/ml。
热失活
80℃ 20 分钟。
使用注意
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NEB代理 , DNA聚合酶与扩增技术 , 等温扩增和链置换,Bst 3.0 DNA 聚合酶,#M0374L
Bst 3.0 DNA 聚合酶
#M0374L 8,000 units
#M0374M 高浓度(15X)8,000 units
#M0374S 1,600 units
特性
概述
Bst 3.0 DNA 聚合酶是 Bacillus stearothermophilus DNA 聚合酶 I,改进了等温扩增性能及反转录活性的大片段同源物,并由电脑模拟设计完成。Bst 3.0 DNA 聚合酶具有对 DNA 或 RNA 模板的 5´ →3´ 聚合酶活性和强链置换活性,但没有 5´→3´ 和 3´ →5´ 核酸外切酶活性。与 Bst DNA 聚合酶相比,Bst 3.0 DNA 聚合酶不仅具有在高浓度 DNA 扩增抑制剂中扩增的强大性能,而且反转录酶的活性也显著增强。
来源
来源于携带重组 Bst 3.0 基因的 E. coli 菌株。
反应缓冲液
1X 等温扩增缓冲液 II [20 mM Tris-HCl(pH 8.8 @ 25℃),150 mM KCl,10 mM (NH4)2S04,2 mM MgS04,0.1% Tween-20]。65℃ 条件下反应。
单位定义:
1 单位指 65℃ 条件下反应 30 分钟,能使 25 nmol 的 dNTPs 掺入酸不溶物所需的酶量。
浓度:
8,000 和 120,000 units/ml。
使用注意:
建议反应温度不超过 72℃。Bst DNA 聚合酶不能用于 PCR 或需热变性的反应。Bst 3.0 DNA聚合酶不具有 3´ →5´ 核酸外切酶活性。
NEB代理 , DNA聚合酶与扩增技术 , 等温扩增和链置换,Bst 2.0 DNA 聚合酶,#M0537L
Bst 2.0 DNA 聚合酶
#M0537L 8,000 units
#M0537M 高浓度(15X)8,000 units
#M0537S 1,600 units
相关产品
WarmStart® RTx 反转录酶
特性
概述
Bst 2.0 WarmStart DNA 聚合酶在等温聚合酶中是独有的。像“热启动”PCR 聚合酶一样,这种特性在低于最适反应温度下可以抑制酶活性。因此,实验操作可以在室温下进行,并可以消除非特异性反应产物,提高反应效率。
NEB 的 Bst 2.0 WarmStart DNA 聚合酶利用了核酸适配体技术。适配体是一种经过广泛修饰的特定核苷酸,通过非共价键作用结合到聚合酶上,从而在非许可温度下抑制酶活性(<50℃)。另外,Bst 2.0 WarmStart DNA 聚合酶不需要单独的激活步骤。
Bst 2.0 WarmStart DNA 聚合酶可以消除在室温条件下建立反应时,产生的非特异性的扩增,而传统的 Bst DNA 聚合酶或同源物可以掺入非模板序列核苷酸。
来源
反应缓冲液
单位定义
浓度
8,000 和 120,000 units/ml。
热失活
80℃ 20 分钟。
使用注意
NEB代理 , DNA聚合酶与扩增技术 , 等温扩增和链置换,Bst 2.0 WarmStart® DNA 聚合酶,#M0538L
Bst 2.0 WarmStart® DNA 聚合酶
#M0538L 8,000 units
#M0538M 高浓度(15X)8,000 units
#M0538S 1,600 units
相关产品
特性
WarmStart DNA 聚合酶可以在室温下建立反应,防止非特异性扩增,提高反应效率
概述
Bst 2.0 WarmStart DNA 聚合酶在等温聚合酶中是独有的。像“热启动”PCR 聚合酶一样,这种特性在低于最适反应温度下可以抑制酶活性。因此,实验操作可以在室温下进行,并可以消除非特异性反应产物,提高反应效率。
NEB 的 Bst 2.0 WarmStart DNA 聚合酶利用了核酸适配体技术。适配体是一种经过广泛修饰的特定核苷酸,通过非共价键作用结合到聚合酶上,从而在非许可温度下抑制酶活性(<50℃)。另外,Bst 2.0 WarmStart DNA 聚合酶不需要单独的激活步骤。
Bst 2.0 WarmStart DNA 聚合酶可以消除在室温条件下建立反应时,产生的非特异性的扩增,而传统的 Bst DNA 聚合酶或同源物可以掺入非模板序列核苷酸。
Bst 2.0 WarmStart 的优势:无论刚建立反应(实线)或 25℃ 温育 2 小时后,都能使 LAMP 实验在相同的时间点迅速启动反应。没有 Bst 2.0 WarmStart 的保护,在室温条件下温育的 LAMP 实验结果不一致。Bst 2.0 WarmStart 让扩增结果更均一,可以室温和高通量建立反应。
来源
来源于 E. coli 菌株,该菌株携带有诱导启动子,可表达 Bst 2.0 DNA 聚合酶蛋白。
反应缓冲液
[20 mM Tris-HCl (pH 8.8 @ 25℃),50 mM KCl,10 mM (NH4)2S04,2 mM MgS04,0.1% Tween-20]。
单位定义
1 单位指 65℃ 条件下反应 30 分钟,能使 25 nmol 的 dNTPs 掺入酸不溶性沉淀物所需的酶量。
浓度
8,000 和 120,000 units/ml。
热失活
80℃ 20 分钟。
使用注意
Bst 2.0 DNA 聚合酶不具有 3´→5´ 核酸外切酶活性。Bst 2.0 WarmStart DNA 聚合酶的反应温度可以为 60-72℃。Bst 2.0 DNA 聚合酶不能用于热循环测序或 PCR。
NEB代理 , DNA聚合酶与扩增技术 , 等温扩增和链置换,Tte UvrD 解旋酶,#M1202S
Tte UvrD 解旋酶
#M1202S 50 reactions
产品描述
该酶是创新酶(Enzyme for Innovation,EFI)。创新酶工程由 NEB 发起,旨在为科研界提供独一无二的酶,从而为新的创新应用的发现创造条件。
特性
使双链 DNA 解旋
概述
Tte UvrD 解旋酶是修复解旋酶,来源于腾冲嗜热厌氧菌(Thermoanaerobacter tengcongensis)。该酶能使双链 DNA 解开而无需特殊的 flap 或突出结构。Tte UvrD 解旋酶适用于广泛的 DNA 底物且耐受高温(70℃)。因此,该酶可做为添加剂,提高等温扩增反应的特异性。
反应条件
1X 等温扩增反应缓冲液,加入 1 mM ATP。
浓度
20μg/ml
NEB代理,WarmStart® 通用 LAMP/RT-LAMP 2X 预混液(含 UDG),#M1708L
WarmStart® 通用 LAMP/RT-LAMP 2X 预混液(含 UDG)
#M1708L 500 rxns
#M1708S 100 rxns
产品特点
设计 LAMP 引物,请使用 NEB LAMP Primer Design Tool
产品描述
WarmStart 通用 LAMP/RT-LAMP 2X 预混液(含 UDG)为 LAMP/RT-LAMP 提供了便捷的一步法解决方案,适用于 DNA 或 RNA 样品。LAMP 和 RT-LAMP 是一种常用等温扩增技术,通过使用 LAMP 特异性引物(用户自备)和链置换 DNA 聚合酶进行靶标核酸的快速检测。该预混液是在优化后 LAMP 缓冲液中混入了 Bst 2.0 WarmStart DNA 聚合酶和 WarmStart RTx 反转录酶。Bst 2.0 WarmStart DNA 聚合酶和 WarmStart RTx 反转录酶均经过基因工程改造,提高了在 LAMP 和 RT-LAMP 反应中的性能。WarmStart 通用 LAMP/RT-LAMP 2X 预混液(含 UDG)具备完全缓冲力,可兼容不同样品类型,适用于多种检测方法,包括:浊度检测、实时荧光检测(使用 LAMP 荧光染料时)和终点可视化检测,例如:基于金属离子指示剂的变色检测(羟基萘酚蓝)
NEB代理,DNA聚合酶与扩增技术,等温扩增和链置换,WarmStart® 变色 LAMP/RT-LAMP 2X 预混液,#M1800L
WarmStart® 变色 LAMP/RT-LAMP 2X 预混液
#M1800L 500次反应
#M1800S 100次反应
优势及特点
概述
WarmStart Colorimetric LAMP 2X Master Mix 是可视化的 LAMP 和 RT-LAMP 反应混合液(LAMP:环介导等温扩增反应)。预混液经过优化,在特殊 Low-buffer 中含有可视化的 PH 值指示剂及 Bst 2.0 WarmStart DNA 聚合酶 和WarmStart RTx 反转录酶。在 LAMP 的反应过程中,DNA 聚合酶发挥聚合作用,改变质子数量进而改变 PH 值,使粉色反应液变成黄色,整个反应过程快速,颜色改变清晰,肉眼可见(可以在视频库中找到关于 LAMP 实验以及引物设计概述https://www.neb.com/tools-and-resources/video-library)。该产品可以用于任何 LAMP 或者 RT-LAMP 反应,只需要提供样品和加热装置,在15—40分钟内就可以用肉眼读取阳性扩增的结果。
简单可视化的扩增结果
阴性的反应结果显示为粉色,阳性的反应结果会变为黄色
NEB代理,DNA聚合酶与扩增技术,等温扩增和链置换,WarmStart® 变色 LAMP/RT-LAMP 2X 预混液,含 UDG,#M1804L
WarmStart® 变色 LAMP/RT-LAMP 2X 预混液(含 UDG)
#M1804L 500 rxns
#M1804S 100 rxns
特性
一步法环介导的等温扩增(LAMP)的便捷解决方案,可用于 DNA 或 RNA 样品检测。
· 扩增反应快速,反应体系由粉红色变为黄色,使检测结果清晰可视化
· 预混液包含 UDG 和 dUTP,杜绝残留污染风险
· WarmStart ®的温启动性能在室温下抑制酶活性,可轻松在室温条件下建立反应体系
· 如需了解 LAMP 及等温扩增的更多信息,请点击Learn more
· 如需了解 LAMP 变色反应在 COVID-19 中的应用,请点击Learn how
阴性结果显示粉红色,阳性结果显示变为黄色
概述
含 UDG 的 WarmStart® LAMP 变色预混液是由 Bst 2.0 WarmStart DNA 聚合酶和 WarmStart® RTx 反转录酶在特殊的低缓冲力反应溶液中优化形成,该溶液包含可视化的 pH 指示剂,使检测 LAMP 和 RT-LAMP 的结果判定更加简单、快捷。预混液中包含的 dUTP 和 UDG 可有效减少反应间的残留污染。
该系统提供了一种快速、清晰可视化的扩增检测方案,其原理为 DNA 聚合酶在 LAMP 扩增反应中产生大量质子,引发 pH 值的下降,从而使反应液颜色从粉红色变为黄色(如需了解 LAMP 概述和引物设计,请观看 NEB 网站相关视频)。该预混液即可用于 LAMP 也可用于 RT-LAMP 反应,仅需加热装置及样品,即可在 15-40 分钟内肉眼判定阳性结果。
简单可视化的扩增检测
NEB代理 , DNA聚合酶与扩增技术 , 等温扩增和链置换,随机引物,#S0101V
随机引物
#S0101V 25 次反应
概述
该引物为修饰的随机六聚寡核苷酸引物,与未经修饰的引物相比,可显著增强 phi29 DNA 聚合酶的延伸扩增效果。
应用
NEB代理 , DNA聚合酶与扩增技术,LAMP 内标对照引物预混液rActin,#S0164S
LAMP 内标对照引物预混液(rActin)
#S0164S 50 reactions
产品特性
· 如需自己设计 LAMP 引物,请使用 NEB LAMP Primer Design Tool
概述
LAMP 内标对照引物预混液靶向 Actin RNA 的跨外显子连接处,是扩增 rActin 的引物(F3、B3、FIP、BIP、LF、LB),用于验证 LAMP 反应中试剂活性、样品处理,以及人源核酸的存在。
该产品为 SARS-CoV-2 快速变色 LAMP 检测试剂盒(NEB #E2019)中的内标对照引物
LAMP 内标对照引物序列(5´→ 3´)
rActin Primer Set | Sequence |
ACTB-F3 | AGTACCCCATCGAGCACG |
ACTB-B3 | AGCCTGGATAGCAACGTACA |
ACTB-FIP | GAGCCACACGCAGCTCATTGTATCACCAACTGGGACGACA |
ACTB-BIP | CTGAACCCCAAGGCCAACCGGCTGGGGTGTTGAAGGTC |
ACTB-LF | TGTGGTGCCAGATTTTCTCCA |
ACTB-LB | CGAGAAGATGACCCAGATCATGT |
NEB代理 , DNA聚合酶与扩增技术 , 等温扩增和链置换,LAMP SARS-CoV-2 引物预混液N/E,#S1883S
LAMP SARS-CoV-2 引物预混液(N/E)
#S1883S 85 reactions
产品特性
· 新型 SARS-CoV-2 突变体对本套引物有何影响?登陆 Primer Monitor 在线工具(更多信息),查看突变体图谱与引物匹配的最新信息。
· 以 10X 浓度提供
· 靶向 SARS-CoV-2 基因组中的 N 基因和 E 基因区域
· 优化形成 2 组引物混合物,提升了 SARS-CoV-2 病毒 RNA 检测的速度和灵敏度
· 为 SARS-CoV-2 快速变色 LAMP 检测试剂盒(NEB #E2019)的组分之一
· 点击如下链接,查看如何使用本套引物和 WarmStart® LAMP(含UDG)试剂检测 SARS-CoV-2 病毒 RNA。https://international.neb.com/-/media/nebus/files/application-notes/appnote_optimizing_rapid_isothermal-workflow_for_sars-cov-2_with_warmstart_lamp_with_udg.pdf?rev=1972ec224ec54ce38f58669cd791e63d
· 如需自己设计 LAMP 引物,请使用 NEB LAMP Primer Design Tool
·了解 LAMP 和其它等温扩增方法
· 全球 LAMP(gLAMP)联盟发表了一篇综述文献,全面回顾了 LAMP 及其在 COVID-19 疫情中的作用。
概述
LAMP SARS-CoV-2 引物预混液(N/E)是一套靶向两个基因的混合引物,可识别 SARS-CoV-2 基因组中的核衣壳蛋白基因(N)和包膜蛋白基因(E)区域。包含分别靶向两个区域的 2 组 LAMP 引物(F3、B3、FIP、BIP、LF、LB),能提高对 SARS-CoV-2 的检测能力。
LAMP SARS-CoV-2 引物序列(5´→ 3´)
Gene N2 Primer Set | Sequence |
E1-F3 | TGAGTACGAACTTATGTACTCAT |
E1-B3 | TTCAGATTTTTAACACGAGAGT |
E1-FIP | ACCACGAAAGCAAGAAAAAGAAGTTCGTTTCGGAAGAGACAG |
E1-BIP | TTGCTAGTTACACTAGCCATCCTTAGGTTTTACAAGACTCACGT |
E1-LF | CGCTATTAACTATTAACG |
E1-LB | GCGCTTCGATTGTGTGCGT |
Gene N2 Primer Set | Sequence |
N2-F3 | ACCAGGAACTAATCAGACAAG |
N2-B3 | GACTTGATCTTTGAAATTTGGATCT |
N2-FIP | TTCCGAAGAACGCTGAAGCGGAACTGATTACAAACATTGGCC |
N2-BIP | CGCATTGGCATGGAAGTCACAATTTGATGGCACCTGTGTA |
N2-LF | GGGGGCAAATTGTGCAATTTG |
N2-LB | CTTCGGGAACGTGGTTGACC |
NEB代理 , DNA聚合酶与扩增技术 , DNA 处理(DNA 标记、末端平齐化等)
T4 DNA 聚合酶
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相关产品
特性
概述
来源
浓度
热失活
75℃ 20 分钟。
注意事项
上海金畔生物科技有限公司官网,NEB代理,订购热线:18301939375
NEB代理 , DNA聚合酶与扩增技术,DNA 聚合酶 I(E. coli),#M0209L
DNA 聚合酶 I(E. coli)
#M0209L 2,500 units
#M0209S 500 units
#M0209V 250 units
特性
·cDNA 第二条链的合成
概述
来源
浓度
10,000 units/ml。
热失活
75℃ 20 分钟。
注意事项
上海金畔生物科技有限公司官网,NEB代理,订购热线:18301939375
NEB代理 , DNA聚合酶与扩增技术,DNA 聚合酶 I 大片段(Klenow),#M0210L
DNA 聚合酶 I 大片段(Klenow)
#M0210L 1,000 units
#M0210M 高浓度(10X)1,000 units
#M0210S 200 units
#M0210V 100 units
特性
·cDNA 第二条链的合成
概述
来源
浓度
5,000 和 50,000 units/ml。
热失活
75℃ 20 分钟。
使用注意事项
上海金畔生物科技有限公司官网,NEB代理,订购热线:18301939375
NEB代理 , DNA聚合酶与扩增技术,Klenow 片段-3’→5’exo-,#M0212L
Klenow 片段(3’→5’exo-)
#M0212L 1,000 units
#M0212M 高浓度(10X)1,000 units
#M0212S 200 units
#M0212V 100 units
特性
cDNA 第二条链的合成
概述
来源
浓度
5,000 和 50,000 units/ml。
热失活
75℃ 20 分钟。
使用注意事项
上海金畔生物科技有限公司官网,NEB代理,订购热线:18301939375
NEB代理 , DNA聚合酶与扩增技术,Therminator™ DNA 聚合酶,#M0261L
Therminator™ DNA 聚合酶
#M0261L 1,000 units
#M0261S 200 units
特性
概述
来源
浓度
2,000 units/ml。
使用注意事项
上海金畔生物科技有限公司官网,NEB代理,订购热线:18301939375
NEB代理 , DNA聚合酶与扩增技术,T7 DNA 聚合酶,未修饰,#M0274L
T7 DNA 聚合酶(未修饰)
#M0274L 1,500 units
#M0274S 300 units
特性
缺口填充(无链置换活性)
概述
来源
反应条件
单位定义
1 单位指在 37℃ 条件下反应 30 分钟,能使 10 nmol 的 dNTP 掺入酸不溶物所需要的酶量。
浓度
10,000 units/ml。
使用注意事项
上海金畔生物科技有限公司官网,NEB代理,订购热线:18301939375
NEB代理,DNA聚合酶与扩增技术,PreCR® 修复混合液,#M0309L
PreCR® 修复混合液
#M0309L 150 次反应
#M0309S 30 次反应
相关产品
特性
不损伤模板
概述
来源
应用
在 PCR 或其它 DNA 技术之前修复 DNA。
试剂组成
纯化的 BSA
使用 PreCR 修复混合液修复不同类型的 DNA 损伤。胶图显示了经过 PreCR 修复混合液处理(+)和未经处理(-)的受损 DNA 的扩增结果。DNA 损伤的类型已经在图上方给出。注意:热处理 DNA 为 99℃ 温育 3 分钟。Marker M 是 2- Log DNA Ladder (NEB #3200)。
DNA 损伤类型
NEB代理,DNA聚合酶与扩增技术,末端转移酶,#M0315L
末端转移酶
#M0315L 2,500 units
#M0315S 500 units
特性
TdT 依赖的 PCR
概述
来源
浓度
20,000 units/ml。
热失活
75℃ 20 分钟。
上海金畔生物科技有限公司官网,NEB代理,订购热线:18301939375
NEB代理,DNA聚合酶与扩增技术,Sulfolobus DNA 聚合酶 IV,#M0327S
Sulfolobus DNA 聚合酶 IV
#M0327S 100 units
特性
DNA 修复
概述
来源
浓度
2,000 units/ml。
上海金畔生物科技有限公司官网,NEB代理,订购热线:18301939375
NEB代理 , DNA聚合酶与扩增技术,Bsu DNA 聚合酶,大片段,#M0330L
Bsu DNA 聚合酶,大片段
#M0330L 1,000 units
#M0330S 200 units
特性
概述
来源
浓度
5,000 units/ml。
热失活
75℃ 20 分钟。
注意事项
25℃ 时 Bsu DNA 聚合酶,大片段 保留 50% 的活性,是同温度下 Klenow 片段(3´→5´ exo–)的两倍。
上海金畔生物科技有限公司官网,NEB代理,订购热线:18301939375
NEB代理,DNA聚合酶与扩增技术,链霉亲和素,#N7021S
链霉亲和素
#N7021S 1 mg
Description
A 52.8 kDa non-glycosylated protein with a very high affinity for biotin. Due to its high affinity for biotin, it is used to bridge biotinylated probes and biotinylated enzymes.
Properties and Usage
Usage Concentration
1 mg/ml
Excitation
0nm
Storage Temperature
-20°C
Storage Conditions
140 mM NaCl
8 mM sodium phosphate
2 mM potassium phosphate
10 mM KCl
pH 7.4 @ 25°C
Related Products
Companion Products
- Phototope®-Star Detection Kit
NEB代理,DNA聚合酶与扩增技术,cDNA 合成,ProtoScript® cDNA 第一链合成试剂盒,#E6300L
ProtoScript® cDNA 第一链合成试剂盒
#E6300L 150 次反应
#E6300S 30 次反应
相关产品
特性
合成至少 5 kb 长度的 cDNA
概述
ProtoScript cDNA 第一链合成试剂盒组分
NEB代理 , DNA聚合酶与扩增技术,ProtoScript® II cDNA 第一链合成试剂盒,#E6560L
ProtoScript® II cDNA 第一链合成试剂盒
#E6560L 150 次反应
#E6560S 30 次反应
相关产品
特性
2 管装混合液方便使用
概述
ProtoScript II cDNA 第一链合成试剂盒组分
– 随机引物混合液(60 μM)、Oligo d(T)23VN 引物(50 μM)**、无核酸酶污染的水
**Oligo d(T)23 VN 和随机引物混合液包含 1 mM dNTP
如需稳定扩增不同种类的 DNA 模板,推荐使用 OneTaq® DNA 聚合酶或 Q5® 超保真 DNA 聚合酶。
NEB代理 , DNA聚合酶与扩增技术 , cDNA 合成,M-MulV 反转录酶,#M0253L
M-MulV 反转录酶
#M0253L 50,000 units
#M0253S 10,000 units
特性
概述
莫洛尼氏鼠白血病病毒(M-MuLV)反转录酶是一种 RNA 介导的 DNA 聚合酶。该酶能以 RNA(合成 cDNA 时)或单链 DNA 做模板由引物起始合成一条互补的 DNA。M-MuLV 反转录酶无 3´→5´ 核酸外切酶活性。
来源
重组 E. coli 菌株,携带有从 M-MuLV 中克隆的反转录酶基因。
反应条件
1X M-MuLV 反转录酶反应缓冲液 [50mM Tris-HCl(pH 8.3 @ 25℃),75 mM KCl,3 mMMgCl2,10 mM DTT],加入 dNTPs(不随酶提供),37-42℃ 温育。热失活:65℃ 20 分钟。
质保声明
无核酸内切酶、外切酶和 RNase 污染。
单位定义
1 单位指以 poly(rA)为模板、oligo(dT)为引物,在 37℃ 条件下,10 分钟内催化 1 nmol 的 dTTP 掺入形成酸不溶物所需要的酶量。
浓度
200,000 units/ml。
NEB代理 , DNA聚合酶与扩增技术,AMV 反转录酶,#M0277L
AMV 反转录酶
#M0277L 1,000 units
#M0277S 200 units
概述
禽骨髓母细胞瘤病毒(AMV)反转录酶是一种 RNA 介导的 DNA 聚合酶。该酶能以 RNA(合成 cDNA 时)或单链 DNA 为模板从引物开始合成互补的 DNA 链。
来源
禽骨髓母细胞瘤病毒(AMV)。
反应条件
1X AMV 反转录酶反应缓冲液 [50 mM
质保声明
无核酸内切酶、外切酶和 RNase 污染。
单位定义
1 单位指以 poly(rA)•oligo(dT)为模板/引
浓度
10,000 units/ml
贮存注意
解冻后,请贮存于 -20℃。反复冻融会导致酶失活。长时间贮存可分装后置于 -70℃。
NEB代理 , DNA聚合酶与扩增技术 , cDNA 合成,ProtoScript® II 反转录酶,#M0368L
ProtoScript® II 反转录酶
#M0368L 10,000 units
#M0368S 4,000 units
#M0368X 40,000 units
相关产品
特性
合成至少 10 kb 长度的 cDNA
概述
来源
反应条件
1X ProtoScript II 反转录酶反应缓冲液[50 mM Tris-HCl(pH 8.3 @ 25℃),75 mM KCl,3mM MgCl2],10 mM DTT,200 units M-MuLV (RNaseH–),添加 0.5 mM dNTPs(不随酶提供)和 5 μMdT23VN(不随酶提供),42℃ 温育 50 分钟。如果使用随机引物建议在室温放置 10 分钟后再进行 42℃ 反应。热失活:65℃ 20 分钟。
质保声明
通过 RT-PCR 验证,以总 RNA 为模板可合成 9.2 kb 的 cDNA。
单位定义
浓度
200,000 units/ml。
NEB代理 , DNA聚合酶与扩增技术 , cDNA 合成,WarmStart®RTx 反转录酶,#M0380L
WarmStart®RTx 反转录酶
#M0380L 250 次反应
#M0380S 50 次反应
特性
概述
WarmStart® RTx 反转录酶是一种依赖 RNA 的 DNA 聚合酶,它利用核酸适配体技术,通过共价键作用结合到聚合酶上,从而抑制 RTx 在 40℃ 以下的活性。WarmStart RTx 以 RNA(cDNA 合成)或单链 DNA 作为模板合成互补 DNA 链。RTx 酶适用于扩增反应中 RNA 的检测,特别适用于 LAMP(环介导等温扩增)实验。WarmStart 特性是:特别适用于高通量反应,室温下建立反应,并提高扩增反应的一致性和特异性。RTx 反转录酶包含完整的 RNase H 活性。
来源
重组 E. coli 菌株,携带有基因工程改造的RTx 基因。
反应条件
质保声明
无核酸内切酶、外切酶和 RNase 污染。
单位定义
浓度
15,000 units/ml。
NEB代理 , DNA聚合酶与扩增技术 , cDNA 合成,Induro™ 反转录酶,#M0681L
Induro™ 反转录酶
#M0681L 10,000 units
#M0681S 4,000 units
产品特性
• 反转录延伸能力强,可快速获得大量长片段 cDNA
产品描述
体验新型反转录酶,感受II 型内含子编码的反转录酶带来的超强反转录活性
Induro 反转录酶是由 II 型内含子编码的反转录酶,在 RNA 反转录合成 cDNA 过程中,展示出更强持续合成能力、热稳定性,以及抑制剂耐受能力。特别适用于长转录本、复杂二级结构,以及含有抑制成分的 RNA 样品反转录合成 cDNA。Induro 反转录酶提升了长转录本的 5′ 端测序覆盖度,因此适用于 RNA-seq 应用,例如:RNA 直接测序、长片段 cDNA 测序。
图 1:Induro 反转录酶的持续合成能力强,能够快速高效合成 cDNA
Induro 反转录酶能够在 55℃ 条件下,5 分钟内合成 12 kb cDNA 全长产物。以体外转录获得的不同长度且带有 Poly (A) 尾的 RNA 作为模板 (1 kb、4 kb、8 kb 或 12 kb),验证全长 cDNA 反转录效果。验证全长 cDNA 的合成效果。首先,合成第一链 cDNA,随后,用 NaOH 水解 RNA 链,然后,将 cDNA 产物等分,分别加入 5´ 特异性引物合成全长双链 cDNA。最后,在琼脂糖凝胶上加入等体积的双链 cDNA 产物进行检测。
图 2:Induro 反转录酶热稳定性能卓越,能够在更高反应温度下稳定合成
Induro 反转录酶能够在 45°C-60°C条件下,10 分钟内合成 12 kb cDNA 全长产物。以体外转录获得的不同长度且带有 Poly (A) 尾的 RNA 作为模板 (1 kb、4 kb、8 kb 或 12 kb),验证全长 cDNA 的合成效果。首先,合成第一链 cDNA,随后,用 NaOH 水解 RNA 链,然后,将 cDNA 产物等分,分别加入 5´ 特异性引物合成全长双链 cDNA。最后,在琼脂糖凝胶上加入等体积的双链 cDNA 产物进行检测。
图 3:Induro 反转录酶合成长片段 cDNA 时,产量最高
转录本长度 ≥8 kb 时,Induro 反转录酶合成的 cDNA 产量最高。以体外转录获得的不同长度且带有 Poly (A) 尾的 RNA 作为模板 (1 kb、4 kb、8 kb 或 12 kb) 。首先,合成第一链 cDNA,随后,水解 RNA 链,加入 5´ 特异性引物合成第二链 cDNA
图 4:Induro 反转录酶能够以复杂的人 RNA 为模板,反转录合成长片段 cDNA
Induro 反转录酶能够以人总 RNA 为模板,分别在 50°C、55°C 或 60°C 条件下,经 10 分钟孵育,合成 >14 kb cDNA 产物。第一链 cDNA 合成后,将产物等分,使用 LongAmp® Taq 2X 预混液 (NEB #M0287) 进行 PCR。
图 5:Induro 反转录酶耐受抑制剂的能力比 TGIRT 更强
与 TGIRT®-III酶 (T) 相比,Induro 反转录酶 (I) 对 RNA 生物样品中常见的抑制成分耐受力更强。在 20 μ 反转录体系中加入 1 μg 长度为 8 kb 的 RNA 体外转录产物(含 poly A)和 oligo dT23VN。所有反应组分(包含 RT 酶)在冰上混合均匀后,加入抑制剂。Induro 的反转录条件为:55°C 10 min,95°C 1 min。TGIRT 的反转录条件为:60℃ 60 min,95℃ 1 min。图中抑制剂含量为其在第一链 cDNA 合成体系中的终浓度。之后加入 5´ 特异性引物合成第二链。
NEB代理,qPCR & RT,qPCR,Luna® 通用一步法 RT-qPCR 试剂盒,#E3005E
Luna® 通用一步法 RT-qPCR 试剂盒
#E3005E 2500次反应
#E3005L 500次反应
#E3005S 200次反应
#E3005X 1000次反应
相关产品
特性
概述
Luna 通用一步法 RT-qPCR 试剂盒组成:
NEB代理 , DNA聚合酶与扩增技术 , qPCR & RT,qPCR,Luna® 通用探针一步法 RT-qPCR 试剂盒,#E3006E
Luna® 通用探针一步法 RT-qPCR 试剂盒
#E3006E 2500次反应
#E3006L 500次反应
#E3006S 200次反应
#E3006X 1000次反应
相关产品
性能与使用
概述
Luna 通用探针一步法 RT-qPCR 试剂盒组成:
– Luna 一步法酶混合液
NEB代理,Luna® 探针一步法 RT-qPCR 试剂盒,无 ROX,#E3007E
Luna® 探针一步法 RT-qPCR 试剂盒(无 ROX)
#E3007E 2,500 rxns
特性
使用探针法 qPCR,快速、灵敏、精准的对目标 RNA 进行检测和定量
概述
Luna 通用探针一步法 RT-qPCR 试剂盒(无 ROX)经过优化,适用于水解探针法的 RNA 实时定量。一步法 RT-qPCR 为 RNA 检测和定量提供了一种便捷、强大的方法。在同一管中,RNA 首先由反转录酶转化为 cDNA,然后使用 DNA 依赖型 DNA 聚合酶扩增 cDNA,从而可以进行 qPCR 定量。基于探针法的 qPCR / RT-qPCR 原理是利用聚合酶的 5´ → 3´ 外切酶活性,将淬灭的目标特异性探针切断发出荧光,并实时监测荧光值的增加,以测量 PCR 每个循环中的 DNA 扩增。在荧光信号显著超过背景荧光的位置,可以确定 Cq 值。Cq 值可用于评估两个或多个样品的靶基因相对丰度,通过已知稀释浓度样品的标准曲线,可对靶基因进行绝对定量。
试剂盒组分
以下试剂随产品提供
储存温度 (°C) |
浓度 |
|
Luna® Probe One-Step Reaction Mix (No ROX) |
-20 |
2 X |
Luna® WarmStart® RT Enzyme Mix |
-20 |
20 X |
Nuclease-free Water |
-20 |
储存温度
-20°C
NEB代理,LunaScript® 反转录 SuperMix 试剂盒,#E3010L
LunaScript® 反转录 SuperMix 试剂盒
#E3010L 100 rxns
#E3010S 25 rxns
相关产品
Luna 通用 qPCR 预混液
特性
·15 分钟内完成 cDNA 第一链的合成
·与 Luna qPCR 预混液搭配使用,RT-qPCR 效果更优异
概述:
LunaScript SuperMix 反转录试剂盒是经过优化的预混液,用于两步法 RT–qPCR 的第一步 cDNA 第一链合成。该预混液最具特色的是采用了耐热 Luna 反转录酶,可在高温下合成 cDNA。预混液中的小鼠 RNase 抑制剂可保护模板 RNA 不被降解。在预混液中同时含有 6 碱基随机引物和 poly-dT 引物,可覆盖全长目标 RNA。
LunaScript SuperMix 反转录试剂盒组分
– LunaScript RT SurperMix
NEB代理,Luna® SARS-CoV-2 多重 RT-qPCR 检测试剂盒,#E3019L
Luna® SARS-CoV-2 多重 RT-qPCR 检测试剂盒
#E3019L 480 rnxs
#E3019S 96 rxns
特性
Luna® SARS-CoV-2 多重 RT-qPCR 检测试剂盒用于 SARS-CoV-2 的实时 RT-PCR 检测
对 2019-nCoV_N1 和 2019-nCoV_N2 靶标以及人源 RNase P 基因进行多重检测,支持高通量检测流程
通过将 RNase P 内标的反向引物设计为跨外显子序列,降低基因组 DNA 的扩增背景
4X 浓度的 RT-qPCR 预混液支持更大的上样量,提高检测灵敏度
Luna 温启动反转录酶和热启动 Taq 酶共同提升反应特异性和功效,可在室温条件下建立体系
预混液中包含热敏 UDG 和 dUTP,防止残留污染
支持混合样品池检测,且不影响灵敏度
欲了解 NEB 如何支持 COVID-19 研究,请点击 COVID-19 research,其中详述了多种 RT-qPCR 病毒检测方案
产品说明
使用 Luna SARS-CoV-2 多重 RT-qPCR 检测试剂盒,在 96 孔板上检测 94 个不同的样本。结果通过荧光通道显示。
Luna® SARS-CoV-2 多重 RT-qPCR 检测试剂盒经过优化,适用于水解探针法的 SARS-CoV-2 实时 RT-PCR 检测。在同一管中,RNA 首先由反转录酶转化为 cDNA,然后使用 DNA 依赖型 DNA 聚合酶扩增 cDNA,从而可以进行 qPCR 定量。基于探针法的 qPCR / RT-qPCR 原理是利用聚合酶的 5´ → 3´ 外切酶活性,将淬灭的目标特异性探针切断发出荧光,并实时监测荧光值的增加,以测量 PCR 每个循环中的 DNA 扩增。在荧光信号显著超过背景荧光的位置,可以确定 Cq 值。Cq 值可用于评估两个或多个样品的靶基因相对丰度。
图 1:Luna® SARS-CoV-2 多重 RT-qPCR 检测试剂盒组分
图 2:Luna SARS-CoV-2 多重 RT-qPCR 检测试剂盒可在一个反应中同时检测两个 N 基因位点和人源 RNase P 基因
A. SARS-CoV-2 的两组引物探针序列源于 CDC 提供,其中探针改为两种荧光标记(N1: HEX, N2: FAM)。
B. RNase P 内标包含 Cy5 标记的探针和重新设计的反向引物。该引物的跨外显子设计,避免了人基因组 DNA(含有 2.4 kb 内含子)的扩增干扰。
SARS-CoV-2 引物/探针混合物包含 SARS-CoV-2 病毒中 N 基因两个区域的引物和探针 [基于美国疾病控制与预防中心(CDC)提供的序列]。两条探针带有不同的荧光标记(N1: HEX;N2: FAM),可在 qPCR 仪器的两个不同通道中同时观测。为了确保检测样品的完整性和无抑制物,还包含一套用于扩增人源 RNase P 基因的内标(IC)引物和探针。该靶基因的反向引物与 CDC 的设计不同,修改为跨外显子序列,以降低残留基因组 DNA 的扩增背景。IC 的扩增可在 Cy5 通道观测。产品同时还提供阳性对照(PC)(含有 SARS-CoV-2 N 基因的质粒)。
该试剂盒包含 Luna 通用探针一步法 RT-qPCR 4X 预混液,含 UDG(NEB #M3019),支持更大的上样量和混合样品池检测,对灵敏度和特异性的影响极小。该预混液包含一步法 RT-qPCR 的所有组分,和独特校对参比染料,可与多种 qPCR 仪器兼容,包括需要高 ROX 或低 ROX 参比信号的仪器。独具特色的是:预混液还包含防止残留污染的热敏 UDG 和 dUTP,以及有助于体系建立的无荧光可见示踪染料。该示踪染料与 qPCR 常用荧光基团的光谱没有重叠,因此不会干扰实时检测。
图 3:Luna SARS-CoV-2 多重 RT-qPCR 检测试剂盒的检测下限比 TaqPath™1-Step RT-qPCR Master Mix, CG 更低
将下述两种试剂盒进行检测下限(LOD)比较:使用 Luna SARS-CoV-2 多重 RT-qPCR 检测试剂盒对 2019-nCoV_N1(HEX)和 2019-nCoV_N2(FAM)进行多重 RT-qPCR 检测,实验设置参照 E3019 产品说明书;使用 TaqPath 1-Step RT-qPCR Master Mix, CG 对 2019-nCoV_ N1(FAM)和 2019-nCoV_N2(FAM)进行单重 RT-qPCR 检测,实验设置参照美国疾控中心 2019-nCoV 实时 RT-PCR 诊断指南。实验样品:将 Twist 公司合成的 SARS-CoV-2 RNA 对照 2 掺入到 10 ng Jurkat 总 RNA 中。实验仪器为 Applied Biosystems® 7500 Fast 实时荧光定量仪 (96 孔板,20 µl 反应体系)。结果显示 Luna 试剂盒对两个靶标的检测下限为 5 拷贝/反应,而 TaqPath 为 10 拷贝/反应。
图 4:Luna SARS-CoV-2 多重 RT-qPCR 检测试剂盒适用于纯化 RNA 的混合样品池检测
通过将一份 2 µl 的模拟阳性样品(10 拷贝的 Twist 合成 SARS-CoV-2 RNA 对照 2 掺入到 10 ng Jurkat 总 RNA)与四份 2 µl 的模拟阴性样品(仅含 10 ng Jurkat 总 RNA)混合,制备出包含五份样品的混合样品池。将混合样品池(10 µl)与单独样品(2 µl,含 10 拷贝 N 基因和 10 ng Jurkat 总 RNA)进行性能比较。实验仪器为 Applied Biosystems® 7500 Fast 实时荧光定量仪(96 孔板,20 µl 反应体系)。N1 和 N2 靶标的扩增曲线显示,单独和掺入混合样品池的阳性样品 Cq 值相似。由于混合样品池中人源总 RNA 量是单独样品的 5 倍,因此正如预期,混合样品池 RNase P 基因的 Cq 值更小。
图 5:Luna SARS-CoV-2 多重 RT-qPCR 检测试剂盒的检测下限(LOD)
通过 Luna SARS-CoV-2 多重 RT-qPCR 检测试剂盒对多种 SARS-CoV-2 RNA 对照样品中的 2019-nCoV_N1(HEX)和 2019-nCoV_N2(FAM)靶标进行多重 RT-qPCR 检测,获得该试剂盒的检测下限(LOD)。实验样品:将 Twist 公司合成的 SARS-CoV-2 RNA 对照 2 掺入到 10 ng Jurkat 总 RNA 中(图 A)。两位实验人员同时使用三种仪器进行平行测试(96 孔板,20 µl 反应体系):Applied Biosystems(ABI)7500 Fast Real-Time instrument、ABI QuantStudio™ 6 Flex Real-Time PCR system,以及 Bio-Rad CFX instrument。结果显示:Twist RNA 的检测下限均为 5 拷贝/反应。此外还测试了其它样品类型(图 B):SARS-CoV-2 基因组 RNA 源自 ATCC(ATCC® VR-1986D™)、NIST(Fragment 1 – Includes SARS-CoV-2 sequence: 25949-29698 of isolate USA-WA1/2020),以及 SeraCare AccuPlex™ SARS-CoV-2 Verification Panel V2(0505-0132)。上述 RNA 均由 Monarch 总 RNA 小量提取试剂盒(NEB# T2010)提取。所有 RNA 样品均掺入到 10 ng Jurkat 总 RNA,使用 ABI 7500 Fast Real-Time instrument 检测。假设 RNA 提取的回收率为 100%,则各样品检测下限为:ATCC 的 SARS-CoV-2 基因组 RNA 为 2.5 GE(genomic copy equivalent)、NIST SARS-CoV-2 测试样品为 1×107 倍稀释、SeraCare AccuPlex 样品为 15 拷贝。
图 6:与 TaqPath 1-Step RT-qPCR Master Mix CG相比,Luna 通用探针一步法 RT-qPCR 4X 预混液,含 UDG 对 SARS-CoV-2 N2 靶标的检测性能更好
A. 使用 Luna 通用探针一步法 RT-qPCR 4X 预混液,含 UDG 对 2019-nCoV_1(HEX)和 2019-nCoV_N2(FAM)进行单重 RT-qPCR,实验设置参照 E3019 产品说明书。B. 使用 TaqPath 1-Step RT-qPCR Master Mix, CG 对 2019-nCoV_N1(FAM)和 2019-nCoV_N2(FAM)进行单重 RT-qPCR,实验设置参照美国疾控中心 2019-nCoV 实时 RT-PCR 诊断指南。实验样品:将 Twist 公司合成的 SARS-CoV-2 RNA 对照 2 掺入到 10 ng Jurkat 总 RNA 中,实验评估了样品 5-log 浓度范围扩增结果。实验仪器为 Applied Biosystems® 7500 Fast 实时荧光定量仪(96 孔板,20 µl 反应体系)。在上述条件下,Luna 和 TaqPath 对 N1 靶标的扩增结果都很好。对于 N2 靶标,尽管 TaqPath 可检测 10 个拷贝样品,但线性度并不理想,而 Luna 线性度更好,且 Cq 值出现更早。
Luna 通用探针一步法 RT-qPCR 4X 预混液,含 UDG 结合了热启动 Taq DNA 聚合酶和具有新型温启动活性的反转录酶,可通过基于适配体的可逆抑制来双重控制酶的活性,这种温控活化机制可避免热循环前的非特异引物结合和扩增,从而让室温建立体系更安全。经改造的 Luna 温启动反转录酶具有更高的热稳定性,最佳反应温度为 55°C。
图 7:Luna RT-qPCR 预混液的室温稳定性让实验流程更灵活
使用 Luna 通用探针一步法 RT-qPCR 4X 预混液,含 UDG 对2019-nCoV_N1(HEX)和 2019-nCoV_N2(FAM)进行单重(SP)和多重(MP)RT-qPCR,实验设置参照 E3019 产品说明书。使用 TaqPath 1-Step RT-qPCR Master Mix, CG 对 2019-nCoV_N1(FAM)和 2019-nCoV_N2(FAM)进行单重 RT-qPCR,实验设置参照美国疾控中心 2019-nCoV 实时 RT-PCR 诊断指南。实验样品:将 Twist 公司合成的 SARS-CoV-2 RNA 对照 2 掺入到 10 ng Jurkat 总 RNA 中,实验评估了样品 5-log 浓度范围(100,000-10 拷贝)的扩增结果。上机前,将 RT-qPCR 反应体系分别室温孵育 0、2、5、24 小时。实验仪器为 Applied Biosystems® 7500 Fast 实时荧光定量仪(96 孔板,20 µl 反应体系)。结果显示 Luna 通用探针一步法 RT-qPCR 预混液孵育 0-24 小时的实验结果一致,而 TaqPath 孵育 2 小时后,Cq值延迟≥1,实验效果随孵育时间的延长而下降。
NEB代理,LunaScript® 反转录预混液试剂盒,无引物,#E3025L
LunaScript® 反转录预混液试剂盒(无引物)
#E3025L 100 rxn
#E3025S 25 rxn
产品特点
产品说明
使用 LunaScript 反转录预混液试剂盒(无引物)将 1 μg Jurkat 总 RNA 反转录成 cDNA,引物为 d(T))23VN,使用标准反应条件 55℃ 孵育 10 分钟,95℃ 孵育 1 分钟。之后使用不同 PCR 扩增试剂对 cDNA 产物进行检测。对于 5 kb以内的常规应用,建议使用 OneTaq 2X 预混液(NEB #M0482);对于高保真扩增,建议使用 Q5 热启动超保真 2X 预混液(NEB #M0494);对于长片段高产量扩增,建议使用 LongAmp Taq 2X 预混液(NEB #M0287)(数据未显示)
NEB代理,Luna® Cell Ready 一步法 RT-qPCR 试剂盒,#E3030S
Luna® Cell Ready 一步法 RT-qPCR 试剂盒
#E3030S 100 rxns
特性
无需纯化,直接从细胞到 RNA 定量
• 试剂盒包含 100 次裂解反应和 500 次染料一步法 RT-qPCR 反应
• 有效裂解多种细胞系的 10 至 10 万个细胞
• 仅需 15 分钟即可完成细胞裂解、RNA 释放和基因组 DNA 去除
• 联合使用 LunaWarmStart® RT 和 Hot Start Taq,提高了热稳定性,且可在室温下建立反应体系
• 可单独购买裂解模块:Luna Cell Ready 裂解模块(NEB#E3032)
概述
Luna Cell Ready 染料一步法 RT-qPCR 试剂盒为直接染料法 RNA 检测和定量提供了所有必要的组分,且无需进行 RNA 提取和纯化。Luna Cell Ready 染料一步法 RT-qPCR 试剂盒包括:1)Luna Cell Ready 裂解模块(NEB#E3032S)和 2)Luna 通用一步法 RT-qPCR Kit(NEB#E3005L)。
细胞培养常用于替代活体生物来分析基因表达或对治疗的反应。传统上使用柱提法或化学试剂法从处理过的细胞中提取和纯化 RNA。
Luna Cell Ready 裂解模块整合了 DNase I 和 Luna Cell Ready 蛋白酶的功能,仅需 15 分钟即可完成细胞裂解、RNA 释放和基因组 DNA 去除。裂解模块包含独特的 Luna Cell Ready RNA 保护试剂,可在细胞裂解过程中保持 RNA 完整性。50 µl 裂解体系下可对 10-10 万个细胞进行裂解反应。2 µl 裂解产物 (相当于 0.2–4000 个细胞的 RNA) 即可实现 20 µl 体系的 RT-qPCR 反应。与其它 Luna 产品一样,裂解缓冲液包含惰性蓝色示踪染料,使整个加样流程可视化。
Luna 通用一步法 RT-qPCR 试剂盒可兼容大多数实时荧光定量仪器的 SYBR/FAM 荧光通道,进行目标 RNA 的实时定量分析。在该试剂盒中,联合使用热启动 Taq DNA 聚合酶与新型 Luna WarmStart 反转录酶,通过适配体可逆抑制来双重控制酶活性。Luna 通用一步法 RT-qPCR 试剂盒可以直接将 Luna Cell Ready 裂解模块制备的细胞裂解物中的 RNA 转录本进行检测和定量。
下表列出的细胞系可使用 Luna Cell Ready 裂解模块裂解。这些细胞进行 5 log 梯度稀释(100000-10 细胞/50 µl 裂解反应),并取 1 ul 裂解产物进行 20 µl 体系的一步法 RT-qPCR 反应。每个细胞系的线性结果区域显示在最后一列。此外,经测试一些昆虫细胞系也能用上述裂解液裂解。
细胞系 |
|
特性 |
菌种 |
50 ml 裂解体系中的细胞数量 |
A549 |
Adherent |
H. sapiens, Lung, carcinoma |
10 – 100,000 |
HEK293 |
Adherent |
H. sapiens, Kidney |
10 – 100,000 |
HeLa |
Adherent |
H. sapiens, Cervix, adenocarcinoma |
10 – 100,000 |
HepG2 |
Adherent |
H. sapiens, Liver, carcinoma |
10 – 100,000 |
NCI-H460 |
Adherent |
H. sapiens, Lung, carcinoma |
10 – 100,000 |
SK-N-SH |
Adherent |
H. sapiens, Brain, Neuroblastoma |
10 – 100,000 |
U2Os |
Adherent |
H. sapiens, Bone, osteosarcoma |
10 – 10,000 |
Jurkat |
Suspension |
H. sapiens, T lymphocyte, leukemia |
10 – 100,000 |
K-562 |
Suspension |
H. sapiens, Lymphoblast, leukemia |
10 – 1,000 |
图一:Luna Cell Ready 一步法 RT-qPCR 实验流程
Luna Cell Ready 一步法 RT-qPCR 试剂盒提供了直接从细胞(50 µl 体系可裂解高达 10 万个细胞)到 RNA 检测和定量的所有组分。Luna Cell Ready 裂解模块整合了 DNase I 和 Luna Cell Ready 蛋白酶的功能,仅需 15 分钟即可完成细胞裂解、RNA 释放和基因组 DNA 去除。2 µl 裂解产物(相当于 0.2–4000 个细胞中的 RNA)即可实现 20 µl 体系的 RT-qPCR 反应。
图二:Luna Cell Ready 染料一步法 RT-qPCR 试剂盒可直接对 5-log 梯度稀释细胞的裂解物进行灵敏精准的 RNA 定量
梯度稀释的 A549 细胞(100,000-10)使用标准反应条件(37°C 裂解 10 分钟,25°C 灭活 5 分钟),在 50 µl 的 Luna Cell Ready 裂解体系(NEB#E3032)中裂解。使用 Luna 通用一步法 RT-qPCR 试剂盒(NEB#E3005)加入 1 μl 细胞裂解物(相当于 20 μl RT-qPCR 反应体系中 0.2-2,000 个细胞)对目的基因(GOI)进行定量,每个浓度的样品都做了重复。结果展示了两个高频靶标(A):β-actin 和一个低频靶标(B):SMG1。右图展示了扩增效率(E)和线性关系(R2)。
图三:Luna Cell Ready 染料一步法 RT-qPCR 试剂盒与提纯 RNA 均可对 5-logs 细胞梯度样品进行精准可信的 RNA 定量
梯度稀释的 A549 细胞(100,000-10)使用标准反应条件(37°C 裂解 10 分钟,25°C 灭活 5 分钟),在 50 µl 的 Luna Cell Ready 裂解体系(NEB#E3032)中裂解,也可使用柱提法提纯 RNA。A.使用 Luna 通用一步法 RT-qPCR 试剂盒(NEB#E3005)对目的基因(GOI)进行定量,加入 1 μl 细胞裂解物(实心圆)或纯化的 RNA(空心圆)(相当于 20 µl RT-qPCR 反应中有 0.2-2,000 个细胞),每个浓度的样品都做了重复。左图:在 5-logs 细胞梯度中检测高频靶标 β-actin和两个低频靶标 ARF3 和 Tubulin。每个靶标的扩增效率在图中左下方显示。B.在 A 图中 5-log 细胞梯度稀释样品的目标基因相对于 β-actin 的 Cq 值(ΔCq(GOI)),平均 Cqs 通过横线指示。
图四:Luna Cell Ready 染料一步法 RT-qPCR 试剂盒的扩增效率及灵敏度均优于其它市售的细胞裂解一步法 RT-qPCR 试剂盒。
梯度稀释的 A549 细胞(100,000-10)使用标准反应条件,在 50 µl 的 Luna Cell Ready 裂解体系(NEB#E3032)中裂解。相同的样品使用 Bio-Rad(SingleShot SYBR Green One-Step Kit, #172-5095)、Qiagen(SingleShot SYBR Green One-Step Kit, #172-5095)和 Thermo Fisher(Cells-to-CT 1-Step PowerSYBR Green Kit, A25600)并分别按照厂家说明书进行裂解。然后使用每个试剂盒中的一步法 RT-qPCR 模块,加入 1 μl 细胞裂解物(相当于 20 μl RT-qPCR 反应体系中 0.2-2,000 个细胞),对目的基因进行定量,每个浓度的样品都做了重复。对于所有试剂盒,5-log 梯度稀释细胞均显示了 β-actin,(高频靶标)和 RPL32、Tubulin (低频靶标)的扩增。为了使结果标准化,将总荧光的 12% 设置为阈值。图中显示了扩增效率(E)及最高与最低的 Cq 值。
图五:对 24 个靶标测试显示,Luna Cell Ready 染料一步法 RT-qPCR 试剂盒与其它市售的细胞裂解一步法 RT-qPCR 试剂盒相比,灵敏度最高。
2500 个 A549 细胞,使用标准反应条件,在 50 µl 的 Luna Cell Ready 裂解体系(NEB#E3032)中裂解。或使用市售的 Bio-Rad(SingleShot SYBR Green One-Step Kit, #172-5095)、Qiagen(SingleShot SYBR Green One-Step Kit, #172-5095)和 Thermo Fisher(Cells-to-CT 1-Step PowerSYBR Green Kit, A25600)并分别按照厂家说明书进行裂解。每个试剂盒做两个生物重复。然后使用来自每个试剂盒的一步法 RT-qPCR 模块,加入 1 μl 细胞裂解物(相当于 20 µl RT-qPCR 反应中 50 个细胞),对 24 个目标基因进行定量,每个生物样品均做重复。结果显示了 NEB (实心橙色圆圈),BioRad(空心正方形),Qiagen(空心三角形)和 Thermo Fisher(十字形)的平均 Cqs。为了使结果标准化,将总荧光的 12% 设置为阈值。Luna Cell Ready 染料一步法 RT-qPCR 试剂盒显示了不同表达水平下 23/24 的基因 Cq 值最早,平均比 Bio-Rad 快2.3 Cq,比 Qiagen 快 3.8 Cq,比 Thermo Fisher 快 3.6 Cq。
随该产品提供的试剂
储存(°C) |
|
浓度 |
|
Luna Cell Ready Lysis Buffer |
-20 |
2 X |
Luna Cell Ready RNA Protection Reagent |
-20 |
25 X |
Luna Cell Ready Protease |
-20 |
25 X |
Luna Cell Ready Stop Solution |
-20 |
10 X |
DNase I (RNase-free) |
-20 |
10 X |
Luna® WarmStart® RT Enzyme Mix |
-20 |
20 X |
Luna® Universal One-Step Reaction Mix |
-20 |
2 X |
Nuclease-free Water |
-20 |
实验需要但不提供的试剂耗材
• 磷酸盐缓冲液(PBS)
• 目标特异性引物
• 细胞
• Eppendorf 管,PCR 联管
• PCR 板
• qPCR 仪器
• 移液器和枪头(为减少交叉污染,应使用带滤芯的枪头)
储存温度
-20℃
NEB代理 , DNA聚合酶与扩增技术 , qPCR & RT,qPCR
Luna® Cell Ready 探针一步法 RT-qPCR 试剂盒 #E3031S100 rxns
特性
无需纯化,直接从细胞到 RNA 定量
• 试剂盒包含 100 次裂解反应和 500 次探针一步法 RT-qPCR 反应
• 有效裂解多种细胞系的 10 至 10 万个细胞
• 仅需 15 分钟即可完成细胞裂解、RNA 释放和基因组 DNA 去除
• 配合使用 LunaWarmStart® RT 和 Hot Start Taq,提高了热稳定性且可在室温下建立反应体系
• 可单独购买裂解模块:Luna Cell Ready 裂解模块(NEB#E3032)
概述
Luna Cell Ready 探针一步法 RT-qPCR 试剂盒为直接探针法 RNA 检测和定量提供了所有必要的组分,且无需进行 RNA 提取和纯化。Luna Cell Ready 探针一步法 RT-qPCR 试剂盒包含两个模块:1)Luna Cell Ready 裂解模块(NEB#E3032S)和 2)Luna 通用探针一步法 RT-qPCR Kit(NEB#E3006L)。
细胞培养常用于替代活体生物来分析基因表达或对治疗的反应。传统上使用柱提法或化学试剂法从处理过的细胞中提取和纯化 RNA。
Luna Cell Ready 裂解模块整合了 DNase I 和 Luna Cell Ready 蛋白酶的功能,仅需 15 分钟即可完成细胞裂解、RNA 释放和基因组 DNA 去除。裂解模块包含独特的 Luna Cell Ready RNA 保护试剂,可在细胞裂解过程中保持 RNA 完整性。50 µl 裂解体系下可对 10-10 万个细胞进行裂解反应。2 µl 裂解产物 (相当于 0.2–4000 个细胞的 RNA) 即可实现 20 µl 体系的 RT-qPCR 反应。与其它 Luna 产品一样,裂解缓冲液包含惰性蓝色示踪染料,使整个加样流程可视化。
Luna 通用探针一步法 RT-qPCR 试剂盒可兼容大多数实时荧光定量仪器的各个通道,进行目标 RNA 的实时定量分析。在该试剂盒中,联合使用热启动 Taq DNA 聚合酶与新型 Luna WarmStart 反转录酶,通过适配体可逆抑制来双重控制酶活性。Luna 通用探针一步法 RT-qPCR 试剂盒可以直接将 Luna Cell Ready 裂解模块制备的细胞裂解物中的 RNA 转录本进行检测和定量(单重或多重)。
下表列出的细胞系可使用 Luna Cell Ready 裂解模块裂解。这些细胞进行 5 log 梯度稀释(100000-10 细胞/50 µl 裂解反应),并取 1 ul 裂解产物进行 20 µl 体系的一步法 RT-qPCR 反应。每个细胞系的线性结果区域显示在最后一列。此外,经测试一些昆虫细胞系也能用上述裂解液裂解。
表一:经验证过的细胞系
细胞系 |
|
特性 |
菌种 |
50 ml 裂解体系中的细胞数量 |
A549 |
Adherent |
H. sapiens, Lung, carcinoma |
10 – 100,000 |
HEK293 |
Adherent |
H. sapiens, Kidney |
10 – 100,000 |
HeLa |
Adherent |
H. sapiens, Cervix, adenocarcinoma |
10 – 100,000 |
HepG2 |
Adherent |
H. sapiens, Liver, carcinoma |
10 – 100,000 |
NCI-H460 |
Adherent |
H. sapiens, Lung, carcinoma |
10 – 100,000 |
SK-N-SH |
Adherent |
H. sapiens, Brain, Neuroblastoma |
10 – 100,000 |
U2Os |
Adherent |
H. sapiens, Bone, osteosarcoma |
10 – 10,000 |
Jurkat |
Suspension |
H. sapiens, T lymphocyte, leukemia |
10 – 100,000 |
K-562 |
Suspension |
H. sapiens, Lymphoblast, leukemia |
10 – 1,000 |
图一:Luna Cell Ready 一步法 RT-qPCR 实验流程
Luna Cell Ready 一步法 RT-qPCR 试剂盒提供了直接从细胞(50 µl 体系可裂解高达 10 万个细胞)到 RNA 检测和定量的所有组分。Luna Cell Ready 裂解模块整合了 DNase I 和 Luna Cell Ready 蛋白酶的功能,仅需 15 分钟即可完成细胞裂解、RNA 释放和基因组 DNA 去除。2 µl 裂解产物(相当于 0.2–4000 个细胞中的 RNA)即可实现 20 µl 体系的 RT-qPCR 反应。
图二:Luna Cell Ready 探针一步法 RT-qPCR 试剂盒可直接对 5-log 梯度稀释细胞的裂解物进行灵敏精准的 RNA 定量
梯度稀释的 A549 细胞(100,000-10)使用标准反应条件(37°C 裂解 10 分钟,25°C 灭活 5 分钟),在 50 µl 的 Luna Cell Ready 裂解体系(NEB#E3032)中裂解。使用 Luna 通用探针一步法 RT-qPCR 试剂盒(NEB#E3006),加入 1 μl 细胞裂解物(相当于 20 μl RT-qPCR 反应体系中 0.2-2,000 个细胞)对目的基因进行定量,每个浓度的样品都做了重复。结果展示了两个高频靶标:β-actin(Texas Red)和 GAPDH(FAM),一个低频靶标:RPL32(HEX),的多重结果(A)和单重结果(B),以及相应的扩增效率(E)和线性关系(R2)。(C)所有三个目标的多重和单重的 Cq 叠加证明了这些结果的一致性。
三:Luna Cell Ready 探针一步法 RT-qPCR 试剂盒与提纯 RNA 均可对 5-logs 细胞梯度样品进行精准可信的 RNA 定量
梯度稀释的 A549 细胞(100,000-10)使用标准反应条件(37°C 裂解 10 分钟,25°C 灭活 5 分钟),在 50 µl 的 Luna Cell Ready 裂解体系(NEB#E3032)中裂解,也可使用柱提法提纯 RNA。A.使用 Luna 通用探针一步法 RT-qPCR 试剂盒(NEB#E3006)对目的基因进行定量,加入 1 μl 细胞裂解物(实心圆,左)或纯化的 RNA(空心圆,右)(上样量相当于 20 µl RT-qPCR 反应中有 0.2-2,000 个细胞),每个浓度的样品都做了重复。在 5-logs 细胞梯度中检测高频靶标 β-actin 和两个低频靶标 ARF3 和 Tubulin。每个靶标的扩增效率在图中左下方显示。
图四:Luna Cell Ready 染料一步法 RT-qPCR 试剂盒的扩增效率及灵敏度均优于其它市售的细胞裂解一步法 RT-qPCR 试剂盒。
梯度稀释的 A549 细胞(100,000-10)使用标准反应条件,在 50 µl 的 Luna Cell Ready 裂解体系(NEB#E3032)中裂解。相同的样品使用 Bio-Rad(SingleShot™ Probes One-Step Kit for Cell Lysis and RT-qPCR, #172-5070)、Qiagen(FastLane Cell Probe Kit, #216413)和 Thermo Fisher(Cells-to-CT 1-Step TaqMan Kit, A25603)并分别按照厂家说明书进行裂解。然后使用每个试剂盒中的一步法 RT-qPCR 模块,加入 1 μl 细胞裂解物(相当于 20 μl RT-qPCR 反应体系中 0.2-2,000 个细胞),对目的基因进行定量,每个浓度的样品都做了重复。5-log 梯度稀释的细胞通过多重实验测试了 β-actin (Tye)、GAPDH (FAM)和 RPL32 (Cy5)的扩增。为了使结果标准化,将每个试剂盒总荧光值的 10%(Tye)、5%(FAM)、15%(Cy5)设置为阈值。图中显示了扩增效率(E)及最高与最低的 Cq 值。
随该产品提供的试剂
储存(°C) |
浓度 |
|
Luna Cell Ready Lysis Buffer |
-20 |
2 X |
Luna Cell Ready RNA Protection Reagent |
-20 |
25 X |
Luna Cell Ready Protease |
-20 |
25 X |
Luna Cell Ready Stop Solution |
-20 |
10 X |
DNase I (RNase-free) |
-20 |
10 X |
Luna® WarmStart® RT Enzyme Mix |
-20 |
20 X |
Luna® Universal Probe One-Step Reaction Mix |
-20 |
2 X |
Nuclease-free Water |
-20 |
实验需要但不提供的试剂耗材
• 磷酸盐缓冲液(PBS)
• 目标特异性引物
• 细胞
• Eppendorf 管
• PCR联管
• PCR 板
• qPCR 仪器
• 移液器和枪头(为减少交叉污染,应使用带滤芯的枪头)
储存温度
-20℃
NEB代理,Luna® Cell Ready 裂解模块,#E3032S
Luna® Cell Ready 裂解模块
#E3032S 100 rxns
特性
概述
细胞培养常用于替代活体生物来分析基因表达或对治疗的反应。传统上使用柱提法或化学试剂法从处理过的细胞中提取和纯化 RNA.Luna Cell Ready 裂解模块无需进行传统的 RNA 提取步骤即可评估RNA表达水平,是一种快速、方便且灵敏的替代方案。该模块可同时进行细胞裂解、RNA 释放、基因组 DNA 去除,获得的细胞裂解物可直接使用Luna通用一步法 RT-qPCR 试剂盒进行 RT-qPCR 分析。与其它 Luna 产品一样,裂解缓冲液包含惰性蓝色示踪染料,使整个加样流程可视化。
下表列出的细胞系可使用 Luna Cell Ready 裂解模块裂解。这些细胞进行 5 log 梯度稀释(100000-10 细胞/50 µl 裂解反应),并取 1 ul 裂解产物进行 20 µl 体系的一步法 RT-qPCR 反应。每个细胞系的线性结果区域显示在最后一列。此外,经测试一些昆虫细胞系也能用上述裂解液裂解。
表一:经验证过的细胞系
细胞系 |
特性 |
菌种 |
50 ml 裂解体系中的细胞数量 |
A549 |
Adherent |
H. sapiens, Lung, carcinoma |
10 – 100,000 |
HEK293 |
Adherent |
H. sapiens, Kidney |
10 – 100,000 |
HeLa |
Adherent |
H. sapiens, Cervix, adenocarcinoma |
10 – 100,000 |
HepG2 |
Adherent |
H. sapiens, Liver, carcinoma |
10 – 100,000 |
NCI-H460 |
Adherent |
H. sapiens, Lung, carcinoma |
10 – 100,000 |
SK-N-SH |
Adherent |
H. sapiens, Brain, Neuroblastoma |
10 – 100,000 |
U2Os |
Adherent |
H. sapiens, Bone, osteosarcoma |
10 – 10,000 |
Jurkat |
Suspension |
H. sapiens, T lymphocyte, leukemia |
10 – 100,000 |
K-562 |
Suspension |
H. sapiens, Lymphoblast, leukemia |
10 – 1,000 |
图一:Luna Cell Ready 一步法 RT-qPCR 实验流程
Luna Cell Ready 裂解模块整合了 DNase I 和 Luna Cell Ready 蛋白酶的功能,可简单高效的进行细胞裂解,仅需 15 分钟即可完成细胞裂解、RNA 释放和基因组 DNA 去除。2 µl 裂解产物(相当于 0.2–4000 个细胞中的 RNA)即可实现 20 µl 体系的 RT-qPCR 反应。
试剂盒组分
随该产品提供的试剂
储存(°C) |
浓度 |
|
Luna Cell Ready Lysis Buffer |
-20 |
2 X |
Luna Cell Ready RNA Protection Reagent |
-20 |
25 X |
Luna Cell Ready Protease |
-20 |
25 X |
Luna Cell Ready Stop Solution |
-20 |
10 X |
DNase I (RNase-free) |
-20 |
10 X |
实验需要但不提供的试剂耗材
- 磷酸盐缓冲液(PBS)
- 目标特异性引物
- 细胞
- Eppendorf 管
- PCR 联管
- PCR 板
- 移液器和枪头(为减少交叉污染,应使用带滤芯的枪头)
储存温度
-20℃
NEB代理,LyoPrime Luna™ 探针一步法 RT-qPCR 预混冻干粉,含 UDG,#L4001S
LyoPrime Luna™ 探针一步法 RT-qPCR 预混冻干粉(含 UDG)
#L4001S 120 reactions
产品特点
LyoPrime Luna™ 探针一步法 RT-qPCR 预混冻干粉(含 UDG)用于灵敏检测靶标 RNA,可在室温条件下稳定保存。该冻干剂型与其液体剂型 [ Luna® 探针一步法 RT-qPCR 4X 预混液(含 UDG)(NEB #M3019)] 具备同样卓越的性能和功效。
· 加入无核酸酶水即可快速复溶
· 未经复溶的冻干试剂,可室温储存长达 2 年
· 无需冷链运输
· 单次检测通量多达 5 个靶标
· Luna 温启动反转录酶与 Taq 热启动 DNA 聚合酶联合使用,提高反应特异性及功效
· 优化的预混试剂中包含热敏 UDG 和 dUTP,防止模板残留污染
· 预混试剂还含有小鼠 RNase 抑制剂,可保持 RNA 的完整性
· 非荧光蓝色示踪染料避免加样错误
· 与多种 qPCR 仪器兼容,包括需要高 ROX 或低 ROX 参比信号的仪器
产品信息
LyoPrime Luna™ 探针一步法 RT-qPCR 预混冻干粉(含 UDG)可在室温条件下运输和保存。仅需加入无核酶水即可快速复溶并使用。该产品适用于水解探针法实时检测靶标 RNA。经优化可同时对高达 5 个靶标进行灵敏、线性的多重检测。稳定的冻干剂型可复溶成 2X 或 4X 浓度的预混液,以满足各种上样需求。
图 1:LyoPrime Luna 为冻干型通用 RT-qPCR 试剂,其性能卓越并可稳定保存
LyoPrime Luna™ RT-qPCR 预混冻干粉(NEB #L4001)与 Luna RT-qPCR 4X 预混液(NEB #M3019)具备相同的性能,该冻干剂型可在室温条件下运输和保存。
图 2:冻干型和液体型 Luna RT-qPCR 预混试剂具备同样优异的性能
A. 使用 LyoPrime Luna™ 探针一步法 RT-qPCR 预混冻干粉(含 UDG)(NEB #L4001) 或 Luna® 探针一步法 RT-qPCR 4X 预混液(含 UDG)(NEB #M3019) 对人 β-actin 靶标进行 RT-qPCR 检测,模板上样量为 8-log 浓度梯度(1 μg–0.1 pg Jurkat 总 RNA),每个浓度重复 4 次,使用 ABI® QuantStudio™ 6 Flex 仪器运行试验。反应体系(20 μl)中,引物浓度为 400 nM,探针浓度为 200 nM,反应设置为产品推荐的循环条件。B. 冻干试剂(金色)和液体试剂(蓝色)的标准曲线基本相同,即使在最低测试浓度下也展现出良好的线性度和重复性。
图 3:LyoPrime Luna 多重检测性能卓越
使用 LyoPrime Luna™ 探针一步法 RT-qPCR 预混冻干粉(含 UDG)对 6-log 浓度梯度的 Jurkat 总 RNA(1 μg-10 pg)进行多重 RT-qPCR,实验仪器为 Bio-Rad CFX96 荧光定量仪。结果显示了 5 个人源靶基因的扩增标准曲线和扩增效率。反应体系(20 μl)中,引物和探针浓度均为 200 nM,反应设置为产品推荐的循环条件。在该多重反应中,5 个靶标均检测到良好的线性度、扩增效率和 R2 值。
图 4:LyoPrime Luna 冻干剂型与其液体剂型性能一致,且优于其它品牌
NEB代理 , DNA聚合酶与扩增技术 , qPCR & RT,qPCR,Luna® 通用 qPCR 预混液,#M3003E
Luna® 通用 qPCR 预混液
#M3003E 2500次反应
#M3003L 500次反应
#M3003S 200次反应
#M3003V 100次反应
#M3003X 1000次反应
相关产品:
特性
概述
快速、灵敏、精确的实时荧光染料定量检测 DNA 和 cDNA
使用实时荧光染料定量 PCR 时,最常用的荧光染料是 SYBR® Green I,后者与双链 DNA 结合,检测每个 PCR 循环中的 DNA 扩增情况。Cq 值是循环数量值,即检测到的荧光信号超过背景本底信号域值所经历的循环数,该 Cq 值可用于评估两个或两个以上的样本之间的相对丰度,也可以与已知浓度系列稀释的标准曲线进行对比,读取样本绝对值。
NEB Luna Universal qPCR Master Mix 是经过优化的 2X 预混液,可以用于实时定量 PCR检测和目标 DNA 的定量,适用于具有 SYBR®/FAM 通道的大部分 qPCR 设备。预混液含有热启动 Taq DNA 聚合酶及独特校正染料,与一系列 qPCR 设备兼容;预混液中使用了 dUTP,以防止产物残留污染;预混液中还加有非荧光染料,便于建立反应时进行肉眼观察,该染料的光谱与 qPCR 荧光染料不重叠,因此不会影响到实时检测数值。
预混液为 2X,包含除了模板和引物以外,用于 PCR 扩增和定量检测的所有组分。可以使用商业化的 qPCR 分析引物,用 Luna qPCR 产品进行基因组 DNA 或者 cDNA 的定量分析。
图表一:NEB 的 Luna Universal qPCR Master Mix 为 qPCR 带来更高灵敏度及可重复性
使用 Luna Universal qPCR Master Mix 检测目标中 GAPDH 基因的表达情况,模板为 6个分别 10 倍稀释的 Jurkat cDNA (20 ng – 0.2 pg),每个浓度的样品做8个复孔。cDNA 是使用 NEB Protoscript® II First Strand cDNA Synthesis Kit (NEB #E6560) 从 Jurkat 的总 RNA 反转录得来。
图表二:NEB 的 Luna Universal qPCR Master Mix 为不同来源的 DNA 都能提供更高灵敏度和精确度的检测和定量
Luna Universal qPCR Master Mix 可以检测不同来源的基因组 DNA。使用 ABI 7500 快速荧光定量仪器,50 ng – 0.5 pg 的基因组 DNA 对目标进行实时定量检测。基因组 DNA使用传统的柱纯化方法纯化。无论从小鼠肾脏的基因组检测 ACTB 基因、烟草基因组 DNA 检测 psbB 基因、还是从酵母基因组 DNA 中检测 rdn18S,Luna 产品都有非常优秀的表现。
图表三:通过与市场上基于染料的 qPCR 试剂对比,NEB 的 Luna 产品体现出了更优的稳定性和特异性
使用 NEB 公司和其它供应商的试剂,分别对来自于 Jurkat 基因组 DNA或 Jurkat cDNA不同丰度、长度和 GC 含量的 16-18 个目的基因进行检测(使用 Bio-Rad 机器检测 10 个基因组模板和 8 cDNA 模板,使用 ABI 的机器检测9个基因组模板和7 个 cDNA 模板)。每份检测结果由两个实验者根据厂商要求分别得到。使用反应效率、最低检测值以及无模板扩增来衡量结果(ΔCq = average Cq of lowest input – average Cq of non-template control)。此外,一致性、可重复性以及曲线的整体质量评估也作为实验的参考(标准分数)。上面的点状图展示了符合可接受的性能标准的百分比(绿框圈起来的点的标准分>3)。不同厂商的结果如上图所示,从左到右分别是:NEB;Bio-Rad, SsoAdvanced™ Universal SYBR® Green Supermix; Roche, FastStart™ SYBR Green Master; QIAGEN, QuantiTect® SYBR Green PCR Kit; ABI, PowerUP™ SYBR Green Master Mix; Promega®, GoTaq® qPCR Master Mix。NEB 的Luna Universal qPCR Master Mix 表现优于所有其它供应商试剂的结果。
注释
1. 引物设计
使用相关软件(如 Primer 3)设计 qPCR 引物时,在减少非特异性扩增和引物二聚体的情况下提高扩增成功率。引物的 GC 含量为 40–60% 可以保证最大的扩增效率。在可能的情况下,尽可能多的输入目标周围区域序列,以便引物序列设计更加完善。使用检索功能,检索相关数据库以避免非特异性扩增。如果模板是 cDNA ,在设计引物的时候可以跨内含子区域来避免基因组的非特异性扩增。相反,如果引物设计在内含子区域则可以保证基因组区域的特异性扩增。
2. 引物浓度
对于大多数模板来说,引物的终浓度 250 nM 就可以达到要求。如果需要的话,引物的浓度可以在 100–500 nM 之间优化。
3. 扩增子长度
为了确保 qPCR 结果的成功和一致性,PCR 效率的最大化非常重要。其中一方面就是设计短的 PCR 产物(70-200 bp)。如果反应产物超出范围,可能需要对实验进行优化(比如增加延伸时间等)
4. 模板准备及相关浓度
Luna qPCR 试剂与通过典型的核酸纯化方法纯化的 DNA 样本都兼容。制备好的 DNA 可以长期稳定储存在包含 EDTA 的缓冲液中(如 1X TE),实验时使用 TE buffer 或者水进行稀释。
一般来说,标准品和未知样品的浓度范围应该在 1 个拷贝到 106 个拷贝之间。如果是大型基因组样本(如人类或老鼠的 gDNA)一般浓度为 50 ng-1 pg。如果是小型基因组样本,可以参考使用1 个拷贝到 106 个拷贝的浓度。对于单一样本的稀释,样本中需要包含多个拷贝和空白对照。对于 cDNA 样本,可以使用 1 μg–0.1 pg 的 RNA 的反转录产物。cDNA 样本不需要纯化,但是在使用之前需要至少稀释 10 倍
5. ROX 校正染料
有些实时定量设备建议使用校正染料(通常是 ROX)来校正由于气泡、微小的体积差别、管与管之间的差异及反应过程中尘埃或者微粒的自发荧光造成的反应差距。Luna Universal qPCR Master Mix 包含了通用型的校正染料,可以兼容不需要使用校正染料以及需要使用低浓度或者高浓度校正染料(ROX)的一系列的荧光定量检测仪器。因此,在使用这些仪器进行 qPCR 实验时,不需要额外的组分。
6. 预防污染
qPCR 是一种非常灵敏的检测方法,前个 qPCR 产物污染下一个样本会带来一系列的问题,如假阳性及灵敏度的下降。防止污染的最好办法就是严格按照程序操作,避免扩增后的开盖。为了进一步满足预防交叉污染的要求,Luna Universal qPCR Master Mix 中包含了 dUTP/dTTP,从而可以在扩增过程中将 U 掺入到 DNA 产物中。qPCR 前使用尿嘧啶 DNA 糖基化酶(UDG)进行预先处理,就可以水解含有尿嘧啶的产物,以防止污染后续试验。使用能够完全失活的 UDG 是至关重要的,否则 UDG 会破坏新合成的 qPCR 产物。
为了避免产物携带污染,在反应体系中加入终浓度为 0.025 units/μl 的南极热敏 UDG(NEB #M0372)。欲将污染的可能性降到最低,最好在室温下建立反应或者在变性步骤前加上
25℃ 温育 10 分钟
7. 反应条件设定
由于聚合酶的热启动性,在实验前不需要预热机器,也不需要在冰上加样。
如果使用96 孔板,建议使用 20 μl 反应体积。
如果使用 384 孔板,建议使用 10 μl 反应体积。在设定仪器的循环条件时,保证在延伸结束时包含一次读板并在循环结束后生成溶解曲线以分析产物的特异性。
大部分应用分析反应 40 个循环就可以,低起始量的样本可以反应 45 个循环。
NEB代理 , DNA聚合酶与扩增技术 , qPCR & RT,qPCR,Luna® 通用探针法 qPCR 预混液,#M3004E
Luna® 通用探针法 qPCR 预混液
#M3004E 2500次反应
#M3004L 500次反应
#M3004S 200次反应
#M3004V 100次反应
#M3004X 1000次反应
相关产品
特性
概述
luna产品选择表
NEB代理,LunaScript® 反转录 SuperMix 预混液,#M3010E
LunaScript® 反转录 SuperMix 预混液
#M3010E 2500 rxns
#M3010L 100 rxns
#M3010X 500 rxns
产品描述
特性
https://www.protocols.io/view/ncov-2019-sequencing-protocol-v3-locost-bp2l6n26rgqe/v3
概述
LunaScript 反转录 SuperMix 为优化的反转录预混液,可用于第一链 cDNA 合成、扩增子测序,以及两步法 RT-qPCR。该预混液含有具备热稳定特性的 Luna 反转录酶,可在更高温下合成 cDNA。试剂盒还提供小鼠 RNase 抑制剂,以保护模板 RNA 免受降解。LunaScript 反转录 SuperMix 预混液含有随机六聚体引物,Oligo-dT 引物,可均匀覆盖整个 RNA 靶标。此外,预混液还包含蓝色染料,可在两步法 RT-qPCR 起到示踪作用。样品起始量从高达 1 µg 到低至单拷贝 RNA,均能得到稳健、线性和灵敏的检测结果。
LunaScript 反转录预混液试剂盒(无引物) (NEB #E3025) 包含除引物外,第一链 cDNA 合成所需的所有组分,适用于 RT-PCR、RNA-seq 及其它应用。该预混液与随机引物、oligo dT 引物以及基因特异性引物兼容,让 cDNA 合成更灵活。更多信息请点击 https://www.neb.cn/products/e3025-lunascript-rt-master-mix-kit-primer-free
与 LunaScript 试剂盒版本 (NEB #E3010) 相比,该 LunaScript 预混液版本不含无核酶水和 No-RT 对照。更多信息如下:
图 1:LunaScript 产品比较
图 2:一步法和两步法 RT-qPCR 产品选择
图 3:LunaScript® SuperMix 反转录预混液在两步法 RT-qPCR 实验中展现了出色的灵敏度、线性关系和重复性
在 20 μl 反应体系中,使用 1 X LunaScript 反转录 SuperMix预混液,在标准反应条件下(25℃/2 分钟,55℃/10 分钟,95℃/1 分钟)将 RNA 反转录为 cDNA。然后使用 1 μl cDNA 作为模板和 Luna 通用 qPCR 预混液(NEB#M3003)进行 qPCR 定量,每种浓度做三个重复。
A. 将梯度稀释的 Jurkat 总 RNA(1 μg–1 pg)反转录为 cDNA,然后对 β-actin 进行 qPCR 定量。
B. ERCC 对照(External RNA Controls Consortium)mix1 RNA 包含 50 – 5×109 拷贝的ERCC00130(10 fg–~10 ng),反转录为 cDNA 后进行 qPCR 进行定量。
图 4:LunaScript 反转录 SuperMix 预混液可覆盖长转录本
在标准反应条件(25℃/2 min、55℃/10 min、95℃/1 min)下,20 μl反应体系中,使用 1X LunaScript 反转录 SuperMix 预混液,将 Jurkat 总 RNA (1 μg – 1 ng) 反转录为 cDNA。取 1 μl cDNA 产物做为模板,使用 Luna 通用 qPCR 预混液 (NEB #M3003) 和覆盖 HERC1 整个 15.2 kb 转录本的 8 对引物,对 cDNA 覆盖度进行 qPCR 评估。结果显示:所有扩增靶标在每个上样浓度的重复实验中,均有良好扩增。
图 5:LunaScript 反转录 SuperMix 预混液对 RNA 靶标展现了出色的线性检测能力
使用市售的 cDNA 合成预混液,根据各厂商产品说明书,将 100 pg–1 μg 人(Jurkat)总 RNA 反转录为 cDNA。然后通过 8 个靶标(丰度、长度和 GC 含量不同)的 qPCR 结果对 cDNA 产物进行评估。使用 Luna 通用 qPCR 预混液(NEB#M3003)或 Luna 通用探针法 qPCR 预混液(NEB#M3004)进行 qPCR 检测。结果评估了扩增效率和 ΔCq,其中 ΔCq 衡量低起始量检测和缺乏无模板对照(NTC)扩增(ΔCq = NTC 的平均 Cq–最低起始量的平均 Cq)。绿色框表示目标扩增表现(效率 = 90-110%,ΔCq≥3)。
了解更多“Dots in Boxes”可视化荧光定量评价方法,请登陆:https://www.neb.cn/tools-and-resources/video-library/dots-in-boxes-visualization-of-qpcr-data
图 6:LunaScript 反转录 SuperMix 预混液的第一链 cDNA 合成时间最短,仅需 13 分钟。
比较了不同厂家的 cDNA 合成方案。LunaScript 反转录 SuperMix 预混液需要的反应时间最短,并可以耐受高温,避免了 RNA 复杂二级结构的影响。
图 7:LunaScript 反转录 SuperMix 预混液在室温条件下稳定性极佳
LunaScript 反转录 SuperMix 预混液与其它市售反转录产品在 25℃条件下放置 15 天,之后在说明书推荐反应条件下,以 100 pg–1 μg 人总 RNA (Jurkat) 为模板,反转录成为 cDNA。使用 Luna 通用 qPCR 预混液(NEB#M3003)对 8 个不同丰度、长度和 GC 含量的靶标进行 qPCR 检测。结果评估了扩增效率和 ΔCq,其中 ΔCq 衡量低起始量检测和缺乏无模板对照(NTC)扩增(ΔCq = NTC 的平均 Cq – 最低起始量的平均 Cq)。绿色框表示目标扩增表现(效率 = 90-110%,ΔCq≥3)。
NEB代理,Luna® 探针一步法 RT-qPCR 4X 预混液,含 UDG,#M3019E
Luna® 探针一步法 RT-qPCR 4X 预混液(含 UDG)
#M3019E 2000 rxns
#M3019L 500 rxns
#M3019S 200 rxns
#M3019X 1000 rxns
特性
Luna 通用探针一步法 RT-qPCR 4X 预混液,含 UDG 可精准检测目标 RNA,多重扩增检测性能优异,一次可检测多达 5 个靶标。
• 单管预混液剂型使反应体系的建立更便捷
• 4X 浓度的预混液可增加样品加入量,提高 RT-qPCR 灵敏度
• 一次可检测多达 5 个靶标,增加检测通量
• Luna 温启动反转录酶与 Taq 热启动 DNA 聚合酶联合使用,提高反应特异性及稳定性并可室温建立体系
• 预混液中包含 UDG 和 dUTP,防止模板残留污染
• 无干扰的可见示踪染料避免加样错误
• 点击 COVID-19 research 了解 NEB 如何将多种 RT-qPCR 病毒检测方法用于新冠研究
产品说明
Luna 通用探针一步法 RT-qPCR 4X 预混液,含 UDG 用于探针法实时荧光定量检测靶标 RNA。首先反转录酶将 RNA 转化为 cDNA,然后 DNA 聚合酶对 cDNA 进行扩增,完成靶标的实时荧光定量 PCR(qPCR),整个过程在单管内一次性完成。基于探针法的 qPCR / RT-qPCR 原理是利用聚合酶的 5´ → 3´ 外切酶活性,将淬灭的目标特异性探针切断发出荧光,并实时监测荧光值的增加,以测量每个循环中的 DNA 扩增。在荧光信号显著超过背景荧光的位置,可以确定 Cq 值。Cq 值可用于评估两个或多个样品的靶基因相对丰度。
两位实验人员按照操作说明书,在几天的时间内,使用 Applied Biosystems™ QuantStudio™ 6 实时 PCR 系统,用两种荧光定量试剂盒分别对 8 个不同丰度、长度和 GC 含量的靶标(通过不同颜色显示)进行一步法 RT-qPCR 测试。反应结果就以下方面进行评估:扩增效率、低样品量检测能力及无模板扩增值(ΔCq=无模板对照的平均 Cq-最低起始量的平均 Cq)。此外,基于前面的度量值(质量得分)还评估了扩增结果的一致性、可重复性和总体曲线质量。结果显示:参与测试的两种试剂均表现不错,但 NEB 测试结果落在绿框里的数量更多,因此 Luna 通用探针一步法 RT-qPCR 4X 预混液,含 UDG 性能优于 TaqPath 1-Step RT-qPCR预混液。
RT-qPCR 的高灵敏度使得避免 DNA 污染尤为重要。由于先前扩增产物可作为后续反应的底物,因此反应体系加入 dUTP 和热敏 UDG 可防止模板残留污染。热敏 UDG 超过50°C时会完全失活,因此对 qPCR 性能没有影响。
该预混液包含无荧光的可见蓝色示踪染料,有助于透明管加样。该示踪染料与 qPCR 常用荧光基团的光谱没有重叠,也不会干扰实时检测。
Luna 通用探针一步法 RT-qPCR 4X 预混液,含 UDG 包含无干扰的可见蓝色示踪染料可避免加样错误
NEB代理 , DNA聚合酶与扩增技术 , RT,PCR,OneTaq® RT-PCR 试剂盒,#E5310S
OneTaq® RT-PCR 试剂盒
#E5310S 30 次反应
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特性
概述
OneTaq RT-PCR 试剂盒组成:
– 10X M-MuLV 酶混合液
NEB代理 , DNA聚合酶与扩增技术 , RT,PCR,OneTaq® 一步法 RT-PCR 试剂盒,#E5315S
OneTaq® 一步法 RT-PCR 试剂盒
#E5315S 30 次反应
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