产品资料 – 核酸纯化 – 基因组DNA提取
Monarch® 高分子量 DNA 提取试剂盒(细胞和血液)
货 号
规 格
价 格(元)
#T3050L
50 preps
4,799.00
无
无
无
无
无
#T3050S
5 preps
839.00
无
无
有
无
无
特性
用于从细胞和血液中提取高分子量 DNA
提取纯化的 DNA 片段大小达到 Mb 范围
通过改变裂解过程中的离心速度,可轻松调节提取 DNA 的片段大小
操作流程简单、便捷(细胞样品 30 分钟,血液样品 60 分钟)
获得的 DNA 产量、纯度和完整性极佳
高效去除 RNA
快速、高效的洗脱
包含 RNase A 和蛋白酶 K
是长片段测序的理想选择
产品说明
Monarch® 高分子量 DNA 提取试剂盒(细胞和血液)为从细胞和血液中提取完整的高分子量(HMW) gDNA 提供了快速的操作流程。该试剂盒利用标准的实验仪器,将以下步骤整合优化,加速了提取过程。实验流程包括:将细胞温和裂解、根据需要提取长度不同的 DNA 片段、以及将 DNA 附着于大玻璃珠表面。根据标准流程提取的 DNA 在 50-250 kb 之间,如果将离心速度降到最低,提取的 DNA 可达 Mb 范围。纯化后的 DNA 产量和纯度极高,且几乎完全不含 RNA。细胞样品的提取时间仅为 30 分钟,血液样本需要红细胞裂解,可在 60 分钟内提取完成。A260 / A280 检测纯度为 1.80-1.90,A260 / A230 检测纯度为 2.2-2.5,实验操作简单、重复性好,纯化后的 HMW DNA 适用于多种下游应用,包括长片段测序(Oxford NanoporeTechnologies®和 PacificBiosciences®),光学图谱(BionanoGenomics®)和 Linked-Reads 基因组组装。
图 1:使用 Monarch 高分子量 DNA 提取试剂盒从细胞中提取纯化 HMW DNA 的操作流程
图 2:使用 Monarch 高分子量 DNA 提取试剂盒从血液中提取纯化 HMW DNA 的操作流程
图 3:Monarch 高分子量 DNA 提取试剂盒从血液和细胞中提取 HMW DNA 的重复性好
使用 Monarch® 高分子量 DNA 提取试剂盒(细胞和血液)提取 DNA。提取样品为 1 x 106 新鲜 HEK293 细胞和 500 µl 新鲜人血样,按照试剂盒说明使用电泳图上方标注的离心速度进行制备。从平行试验样本中分别取 500 ng DNA 产物通过 PFGE 分离(在 BioRad® CHEF-DR® III 系统上,使用 1% 琼脂糖凝胶,6 V / cm,13℃ 电泳 20 小时,切换时间为 0.5-94 秒)。各样品的产量和纯度见下表标注。分子量标准为 Lambda PFG Ladder(NEB#N0341)。
图 4:在从细胞和血液中提取 HMW 基因组 DNA 的裂解过程中,使用不同的离心速度可调节提取片段长度
将 1 x 106 HEK 293细胞和 500 μl 新鲜人血样一式两份提取 HMW DNA。在裂解步骤中,按照图中标注的速度离心样品,以控制 DNA 的片段化。从平行实验样本中取等量的 DNA 产物(细胞:500 ng;血液:650 ng)通过 PFGE 分离(在 BioRad® CHEF-DR® III 系统上,使用 1% 琼脂糖凝胶,6 V / cm,13℃ 电泳 20 小时,切换时间为 0.5-94 秒)。各样品的产量、纯度和 DIN 值见下表标注。分子量标准为 Lambda PFG Ladder 和 Lambda DNA-Hind III 消化 (NEB #T3041 and #N3012) 。
图 5:细胞和血液样本上样量与 DNA 产量的线性相关性
根据说明书操作方案,将 HEK293 培养细胞和来自不同供体的新鲜人血样作为样品提取 HMW DNA 并记录产量数据,裂解步骤中离心速度为 2,000 rpm。将原始样品稀释成 5 个不同的浓度,以覆盖建议上样量范围。细胞样品(≤5×105)和血液样品(<500 µl)使用低样品量推荐的上样体积进行纯化。在测量范围内,上样量与产量呈高度线性相关。