NEB代理,LunaScript® 反转录 SuperMix 预混液,#M3010E

产品资料 – DNA聚合酶与扩增技术 – qPCR & RT-qPCR

LunaScript® 反转录 SuperMix 预混液

#M3010E 2500 rxns

#M3010L 100 rxns

#M3010X 500 rxns

产品描述

该产品为不含 No-RT 对照和无核酶水的预混液剂型
LunaScript® 反转录 SuperMix 试剂盒 (NEB #E3010) 包含反转录预混液、No-RT 对照、无核酶水
适用于 ARTIC SARS-CoV-2 测序流程,是 NEBNext® ARTIC SARS-CoV-2 试剂盒中的组分之一。

特性

· 单管预混液剂型,包含:随机六聚体引物和 oligo-dT 引物、dNTP、小鼠 RNase 抑制剂,以及 Luna 反转录酶。
·15 分钟内即可完成第一链 cDNA 合成,
·新型热稳定型 Luna 反转录酶能够有效改善实验表现
·与 Luna qPCR 预混液 (NEB #M3003,M3004) 联合使用,提升 RT-qPCR 检测功效
·包含无干扰、可视化蓝色示踪染料,有助于减少加样错误
·无引物剂型货号为 NEB #E3025
·该产品为不含无核酶水和 No-RT 对照的预混液剂型
1.   Josh Quick 2020. nCoV-2019 sequencing protocol v3 (LoCost).
https://www.protocols.io/view/ncov-2019-sequencing-protocol-v3-locost-bp2l6n26rgqe/v3

概述

 LunaScript 反转录 SuperMix 为优化的反转录预混液,可用于第一链 cDNA 合成、扩增子测序,以及两步法 RT-qPCR。该预混液含有具备热稳定特性的 Luna 反转录酶,可在更高温下合成 cDNA。试剂盒还提供小鼠 RNase 抑制剂,以保护模板 RNA 免受降解。LunaScript 反转录 SuperMix 预混液含有随机六聚体引物,Oligo-dT 引物,可均匀覆盖整个 RNA 靶标。此外,预混液还包含蓝色染料,可在两步法 RT-qPCR 起到示踪作用。样品起始量从高达 1 µg 到低至单拷贝 RNA,均能得到稳健、线性和灵敏的检测结果。

LunaScript 反转录预混液试剂盒(无引物) (NEB #E3025) 包含除引物外,第一链 cDNA 合成所需的所有组分,适用于 RT-PCR、RNA-seq 及其它应用。该预混液与随机引物、oligo dT 引物以及基因特异性引物兼容,让 cDNA 合成更灵活。更多信息请点击 https://www.neb.cn/products/e3025-lunascript-rt-master-mix-kit-primer-free

与 LunaScript 试剂盒版本 (NEB #E3010) 相比,该 LunaScript 预混液版本不含无核酶水和 No-RT 对照。更多信息如下:

图 1:LunaScript 产品比较

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图 2:一步法和两步法 RT-qPCR 产品选择

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图 3:LunaScript® SuperMix 反转录预混液在两步法 RT-qPCR 实验中展现了出色的灵敏度、线性关系和重复性

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在 20 μl 反应体系中,使用 1 X LunaScript 反转录 SuperMix预混液,在标准反应条件下(25℃/2 分钟,55℃/10 分钟,95℃/1 分钟)将 RNA 反转录为 cDNA。然后使用 1 μl cDNA 作为模板和 Luna 通用 qPCR 预混液(NEB#M3003)进行 qPCR 定量,每种浓度做三个重复。
A. 将梯度稀释的 Jurkat 总 RNA(1 μg–1 pg)反转录为 cDNA,然后对 β-actin 进行 qPCR 定量。
B. ERCC 对照(External RNA Controls Consortium)mix1 RNA 包含 50 – 5×109 拷贝的ERCC00130(10 fg–~10 ng),反转录为 cDNA 后进行 qPCR 进行定量。

图 4:LunaScript 反转录 SuperMix 预混液可覆盖长转录本

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在标准反应条件(25℃/2 min、55℃/10 min、95℃/1 min)下,20 μl反应体系中,使用 1X LunaScript 反转录 SuperMix 预混液,将 Jurkat 总 RNA (1 μg – 1 ng) 反转录为 cDNA。取 1 μl cDNA 产物做为模板,使用 Luna 通用 qPCR 预混液 (NEB #M3003) 和覆盖 HERC1 整个 15.2 kb 转录本的 8 对引物,对 cDNA 覆盖度进行 qPCR 评估。结果显示:所有扩增靶标在每个上样浓度的重复实验中,均有良好扩增。

 

图 5:LunaScript 反转录 SuperMix 预混液对 RNA 靶标展现了出色的线性检测能力

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使用市售的 cDNA 合成预混液,根据各厂商产品说明书,将 100 pg–1 μg 人(Jurkat)总 RNA 反转录为 cDNA。然后通过 8 个靶标(丰度、长度和 GC 含量不同)的 qPCR 结果对 cDNA 产物进行评估。使用 Luna 通用 qPCR 预混液(NEB#M3003)或 Luna 通用探针法 qPCR 预混液(NEB#M3004)进行 qPCR 检测。结果评估了扩增效率和 ΔCq,其中 ΔCq 衡量低起始量检测和缺乏无模板对照(NTC)扩增(ΔCq = NTC 的平均 Cq–最低起始量的平均 Cq)。绿色框表示目标扩增表现(效率 = 90-110%,ΔCq≥3)。
了解更多“Dots in Boxes”可视化荧光定量评价方法,请登陆:https://www.neb.cn/tools-and-resources/video-library/dots-in-boxes-visualization-of-qpcr-data

图 6:LunaScript 反转录 SuperMix 预混液的第一链 cDNA 合成时间最短,仅需 13 分钟。

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比较了不同厂家的 cDNA 合成方案。LunaScript 反转录 SuperMix 预混液需要的反应时间最短,并可以耐受高温,避免了 RNA 复杂二级结构的影响。

图 7:LunaScript 反转录 SuperMix 预混液在室温条件下稳定性极佳

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LunaScript 反转录 SuperMix 预混液与其它市售反转录产品在 25℃条件下放置 15 天,之后在说明书推荐反应条件下,以 100 pg–1 μg 人总 RNA (Jurkat) 为模板,反转录成为 cDNA。使用 Luna 通用 qPCR 预混液(NEB#M3003)对 8 个不同丰度、长度和 GC 含量的靶标进行 qPCR 检测。结果评估了扩增效率和 ΔCq,其中 ΔCq 衡量低起始量检测和缺乏无模板对照(NTC)扩增(ΔCq = NTC 的平均 Cq – 最低起始量的平均 Cq)。绿色框表示目标扩增表现(效率 = 90-110%,ΔCq≥3)。